More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3492 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3492  Alpha/beta hydrolase fold-3  100 
 
 
318 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000681544  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3343  lipolytic protein  70.44 
 
 
318 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3182  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.75 
 
 
315 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3507  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  59.18 
 
 
315 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0144052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3312  putative lipase protein  58.23 
 
 
322 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.1 
 
 
335 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  39.62 
 
 
317 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.2 
 
 
308 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.27 
 
 
311 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.41 
 
 
311 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.91 
 
 
307 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  34.73 
 
 
309 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.59 
 
 
313 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  36.34 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.95 
 
 
318 aa  153  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  33.66 
 
 
314 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  41.3 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  38.89 
 
 
321 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.69 
 
 
376 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.44 
 
 
331 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  35.61 
 
 
338 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.6 
 
 
320 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.92 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.69 
 
 
301 aa  146  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.21 
 
 
317 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05191  esterase/lipase protein  37.68 
 
 
310 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00691331  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.15 
 
 
311 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.93 
 
 
339 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  37.96 
 
 
312 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.42 
 
 
310 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.34 
 
 
314 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.78 
 
 
310 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0613  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.98 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.52 
 
 
316 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.15 
 
 
326 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.69 
 
 
324 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.77 
 
 
351 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.85 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.01 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.44 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.44 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.83 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.66 
 
 
337 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  38.58 
 
 
312 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.74 
 
 
313 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  33.22 
 
 
310 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  37.09 
 
 
344 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  35.51 
 
 
319 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  35.51 
 
 
319 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  35.51 
 
 
321 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  35.51 
 
 
321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.59 
 
 
349 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  35.51 
 
 
321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3357  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.26 
 
 
303 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  35.51 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.45 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  33.86 
 
 
323 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 
338 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  35.14 
 
 
319 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.43 
 
 
309 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.1 
 
 
319 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.35 
 
 
320 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.81 
 
 
339 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2787  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.21 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  0.113664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4218  lipase/esterase family protein  32.51 
 
 
318 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.1 
 
 
339 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  29.75 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.28 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.28 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.83 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.74 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  29.45 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  38.75 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  33.45 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.15 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.04 
 
 
350 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2852  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.18 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  33.46 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.45 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.25 
 
 
309 aa  133  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.83 
 
 
352 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.82 
 
 
337 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  37.63 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1756  lipolytic enzyme  32.62 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.33 
 
 
323 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.86 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  33.09 
 
 
337 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  35.92 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.71 
 
 
310 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5453  putative exported lipase/esterase  34.67 
 
 
319 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.96 
 
 
320 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 
301 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  32.08 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.53 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.307308 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.08 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.5 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  34.46 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.25 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.94 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.97 
 
 
316 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>