More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3182 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3182  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
315 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3507  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  93.97 
 
 
315 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0144052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3312  putative lipase protein  76.9 
 
 
322 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3492  Alpha/beta hydrolase fold-3  59.75 
 
 
318 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000681544  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3343  lipolytic protein  60.69 
 
 
318 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326128  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.74 
 
 
308 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.67 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.79 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  39.54 
 
 
309 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  33.44 
 
 
321 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  33.85 
 
 
321 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.23 
 
 
311 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  40.87 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  36.09 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.23 
 
 
329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0746  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.07 
 
 
331 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.192331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.85 
 
 
320 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.5 
 
 
313 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  36.73 
 
 
310 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.19 
 
 
301 aa  136  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.59 
 
 
351 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.33 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3098  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.92 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  35.31 
 
 
311 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.11 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.12 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.45 
 
 
311 aa  132  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.55 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2832  esterase/lipase/thioesterase  32.34 
 
 
334 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.378186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1969  esterase/lipase/thioesterase  34.09 
 
 
338 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574416  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.81 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.25 
 
 
335 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.33 
 
 
375 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.14 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.57 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.44 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.96 
 
 
371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  36.13 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  40.64 
 
 
305 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.22 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.66 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1827  lipolytic protein  33.64 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.65 
 
 
319 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2080  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.65 
 
 
339 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1958  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
339 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0704762  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.72 
 
 
321 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.93 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.45 
 
 
310 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.45 
 
 
310 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  36.16 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  36.16 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  36.16 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  33.78 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  36.16 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  36.16 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  36.16 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.5 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2661  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.69 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.74 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.5 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2828  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.92 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.5 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1766  lipase  33.59 
 
 
339 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.32 
 
 
319 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.13 
 
 
320 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.43 
 
 
313 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.97 
 
 
312 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  36.13 
 
 
319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_003296  RS05191  esterase/lipase protein  36.45 
 
 
310 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00691331  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.7 
 
 
318 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.51 
 
 
319 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5954  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 
344 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350499  normal  0.849659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.56 
 
 
319 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  38.36 
 
 
327 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.67 
 
 
339 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.36 
 
 
317 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.51 
 
 
319 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 
344 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1419  lipolytic protein  38.12 
 
 
383 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.252701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2286  carboxylesterase Est2  35.06 
 
 
319 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.124272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.45 
 
 
350 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.02 
 
 
352 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  34.56 
 
 
312 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  40.56 
 
 
312 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  34.65 
 
 
339 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  34.38 
 
 
316 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.36 
 
 
325 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.29 
 
 
316 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.4 
 
 
309 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3357  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.98 
 
 
303 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  35.79 
 
 
320 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3998  esterase/lipase/thioesterase  33.33 
 
 
337 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000526107  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.14 
 
 
321 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3651  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.96 
 
 
373 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.96 
 
 
371 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  35.62 
 
 
344 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2525  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.5 
 
 
320 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.253728  hitchhiker  0.0086518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1654  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.27 
 
 
356 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0587  lipase  32.69 
 
 
337 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.26 
 
 
326 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>