More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1444 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  100 
 
 
325 aa  661    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.47 
 
 
320 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  22.09 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.02 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  29.23 
 
 
444 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.29 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.27 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  20.86 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.15 
 
 
376 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.05 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.45 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  38 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  49.57 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0552  acetyl esterase  30.65 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0542  acetyl esterase  30.65 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0536  acetyl esterase  30.65 
 
 
323 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.1 
 
 
370 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.3 
 
 
312 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  29.88 
 
 
314 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0537  acetyl esterase  30.24 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.76 
 
 
313 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  27.6 
 
 
303 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.07 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.38 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.56 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.97 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.69 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.73 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.59 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1333  putative lipase  26.56 
 
 
328 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0109525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.23 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.1 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.1 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.17 
 
 
317 aa  86.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  35.71 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4533  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.82 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768836  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1772  esterase/lipase protein  41.8 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  28.76 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.62 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.16 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.14 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.16 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.17 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.88 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.47 
 
 
311 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.05 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  24.83 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  39.84 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.78 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.86 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  31.28 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  29.04 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  34.51 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.46 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0848  putative carboxylesterase  31.71 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000392053 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  25.3 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.17 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0755  GDXG family lipase  28.52 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00390  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.53 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.96 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  30.4 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.84 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.84 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3151  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.26 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.84 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  37.08 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  41.07 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  36.36 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.18 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.36 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1249  esterase/lipase  26.24 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0945507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.99 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.78 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1434  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.7 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.05 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365819  normal  0.925115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.55 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.4 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  41.38 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.65 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.55 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.95 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.24 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.64 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3675  esterase/lipase/thioesterase  30.15 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2149  esterase  36.43 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.95 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.17 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  41.67 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  41.67 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  41.67 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  41.67 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.88 
 
 
277 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  41.67 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.7 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.7 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  41.67 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.61 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.7 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>