More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2781 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  53.62 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  52.08 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  50.17 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  46.69 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  41.78 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  34.07 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  34.11 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.87 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  34.18 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  34.98 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  48.44 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  30 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  45.38 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.08 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.2 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  46.88 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.74 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  45.74 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  40 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  33.51 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.9 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.1 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.31 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  38.46 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  38.76 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  35.61 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.17 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.8 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.84 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  36.89 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.18 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.84 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.11 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  30.58 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.72 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  42.74 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.43 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.96 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2303  esterase/lipase-like protein  35.71 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.12 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  41.6 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  41.6 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  41.6 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  41.6 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  41.6 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  41.6 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.02 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.84 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.17 
 
 		 1094 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  39.71 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  39.25 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  38.84 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.4 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.38 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  41.67 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2107  hypothetical protein  29.75 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  35.11 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.96 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.96 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.23 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  42.74 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.18 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.57 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  34.71 
 
 		 547 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  33.33 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.74 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  43.12 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.47 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  36.09 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  36.13 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  42.98 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.86 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.3 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365819  normal  0.925115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  33.63 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.28 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  37.07 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.67 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  45.92 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  45.92 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  45.92 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.21 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1170  carboxylesterase, type B  40.91 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244419  normal  0.980563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  35.77 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  37.9 
 
 		 497 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.62 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  33.16 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  30.08 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3037  carboxylesterase, type B  33.83 
 
 		 479 aa  68.9  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.505408  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  37.17 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  28.1 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3813  Carboxylesterase type B  39.82 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  34.96 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  35.2 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  34.96 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.16 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.83 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>