More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3352 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  100 
 
 
442 aa  841    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  58.17 
 
 
500 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  55.29 
 
 
468 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  54.86 
 
 
468 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  54.86 
 
 
468 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  42.02 
 
 
507 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  43.58 
 
 
497 aa  310  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  40.98 
 
 
497 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  46.06 
 
 
477 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  40.7 
 
 
496 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  37.68 
 
 
503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  39.29 
 
 
456 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  37.37 
 
 
529 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  34.92 
 
 
506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  36.56 
 
 
472 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  34.9 
 
 
498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  40.41 
 
 
487 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  36.88 
 
 
506 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  37.17 
 
 
502 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  37.61 
 
 
519 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  35.27 
 
 
490 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  36.13 
 
 
517 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  35.89 
 
 
502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  35.68 
 
 
528 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  36.08 
 
 
502 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  35.99 
 
 
506 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  35.44 
 
 
553 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  37.21 
 
 
501 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  37.45 
 
 
496 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  36.92 
 
 
491 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  37.19 
 
 
503 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1015  Carboxylesterase type B  36.19 
 
 
474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  35 
 
 
502 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  36.24 
 
 
497 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0874  carboxylesterase, type B  33.4 
 
 
519 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  34.98 
 
 
501 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  34.79 
 
 
511 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1541  Carboxylesterase type B  38.68 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  hitchhiker  0.00729389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  32.37 
 
 
542 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  31.99 
 
 
553 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  34.76 
 
 
547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  34.35 
 
 
518 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  32.72 
 
 
507 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  35.02 
 
 
540 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  36.08 
 
 
520 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  36.34 
 
 
523 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0612  Carboxylesterase type B  37.33 
 
 
430 aa  176  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  34.17 
 
 
516 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  31.41 
 
 
555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  34.17 
 
 
535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  34.17 
 
 
535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  33.05 
 
 
502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  33.6 
 
 
520 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
502 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  36.02 
 
 
523 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  36.02 
 
 
523 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  36.02 
 
 
523 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
502 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
502 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  33.4 
 
 
527 aa  170  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  36.31 
 
 
547 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  33.05 
 
 
502 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  31.46 
 
 
569 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  35.21 
 
 
537 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  33.05 
 
 
518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  32.72 
 
 
533 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  31.85 
 
 
541 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  31.78 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  33.27 
 
 
525 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  32.98 
 
 
553 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  32.39 
 
 
534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  33.54 
 
 
525 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  35.99 
 
 
507 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  36.76 
 
 
543 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  40.74 
 
 
503 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  33.05 
 
 
502 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  31.4 
 
 
551 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0145  carboxylesterase, type B  34.75 
 
 
445 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  31.09 
 
 
507 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  32.42 
 
 
513 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  27.43 
 
 
552 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  31.16 
 
 
553 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  35.08 
 
 
486 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  34.8 
 
 
544 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  35.03 
 
 
531 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  34.66 
 
 
576 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  28.69 
 
 
553 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  31.34 
 
 
523 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  32.97 
 
 
524 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12560  carboxylesterase type B  34.7 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.982249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  42.08 
 
 
508 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0247  Acetylcholinesterase  37.68 
 
 
517 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  30.77 
 
 
506 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  33.08 
 
 
546 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2002  Carboxylesterase  31.34 
 
 
527 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  32.86 
 
 
528 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2344  carboxylesterase, type B  35.44 
 
 
498 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.865646  normal  0.0140105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2352  carboxylesterase, type B  35.44 
 
 
498 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  32.98 
 
 
508 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  36.36 
 
 
565 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>