More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4223 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  100 
 
 
553 aa  1087    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  41.2 
 
 
534 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  40.67 
 
 
527 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0226  carboxylesterase, type B  39.51 
 
 
519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  37.79 
 
 
553 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  34.35 
 
 
555 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1847  carboxylesterase type B  39.59 
 
 
556 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105867  normal  0.0362661 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3517  carboxylesterase, type B  38.19 
 
 
514 aa  276  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  34.46 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  34.96 
 
 
506 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4876  carboxylesterase type B  31.58 
 
 
565 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370989  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  34.03 
 
 
506 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2185  Carboxylesterase type B  33.75 
 
 
553 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0323938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  31.82 
 
 
542 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  35.38 
 
 
498 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3037  carboxylesterase, type B  35.06 
 
 
479 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.505408  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  33.21 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  34.6 
 
 
540 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  33.46 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  36.06 
 
 
506 aa  219  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  33.01 
 
 
518 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  34.12 
 
 
500 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  33.9 
 
 
523 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  31.09 
 
 
541 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  33.53 
 
 
519 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  29.32 
 
 
551 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  33.33 
 
 
490 aa  207  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  35.31 
 
 
523 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  35.31 
 
 
523 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  35.31 
 
 
523 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  35.36 
 
 
523 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  31.51 
 
 
503 aa  203  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  33.79 
 
 
496 aa  201  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  31.48 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  33.4 
 
 
547 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  31.27 
 
 
501 aa  197  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  32.56 
 
 
529 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  33.33 
 
 
477 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12560  carboxylesterase type B  33.21 
 
 
531 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.982249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  34.44 
 
 
501 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  30.77 
 
 
513 aa  192  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  31.21 
 
 
551 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  32.41 
 
 
497 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  34.95 
 
 
547 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  30.56 
 
 
502 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  33.33 
 
 
553 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  34.63 
 
 
497 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  30.97 
 
 
502 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  30.97 
 
 
502 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  30.97 
 
 
502 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  31.67 
 
 
518 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  29.86 
 
 
529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  30.75 
 
 
502 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  33.64 
 
 
486 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  31.04 
 
 
508 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  30.84 
 
 
554 aa  179  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  33.87 
 
 
553 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  33.7 
 
 
508 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  33.2 
 
 
472 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  32.29 
 
 
525 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2344  carboxylesterase, type B  35.29 
 
 
498 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.865646  normal  0.0140105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2352  carboxylesterase, type B  35.29 
 
 
498 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  30.24 
 
 
502 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  32.06 
 
 
544 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  34.39 
 
 
531 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  28.2 
 
 
546 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  33.49 
 
 
468 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  33.72 
 
 
468 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  33.49 
 
 
468 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  30.93 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  31.39 
 
 
507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  29.77 
 
 
502 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  33.33 
 
 
501 aa  173  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  29.39 
 
 
543 aa  173  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  33.66 
 
 
487 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  29.84 
 
 
528 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  29.84 
 
 
502 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  33.68 
 
 
520 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  31.08 
 
 
502 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  31.17 
 
 
552 aa  172  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  32.32 
 
 
532 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  34.01 
 
 
516 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4535  Carboxylesterase  30.35 
 
 
492 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  34.01 
 
 
535 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  34.01 
 
 
535 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  30.49 
 
 
502 aa  170  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3026  Carboxylesterase type B  31.61 
 
 
509 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7204  carboxylesterase type B  32.22 
 
 
529 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  32.13 
 
 
456 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  31.93 
 
 
507 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  39.46 
 
 
537 aa  166  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  34.75 
 
 
503 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  29.84 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2379  Carboxylesterase type B  31.37 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  34.36 
 
 
524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0874  carboxylesterase, type B  29.08 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  31.63 
 
 
524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  31.47 
 
 
496 aa  164  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  31.81 
 
 
528 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  31.49 
 
 
491 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>