More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12560  carboxylesterase type B  100 
 
 
531 aa  1039    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.982249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  38.67 
 
 
519 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  36.12 
 
 
506 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  35.58 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  36.42 
 
 
517 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  38.13 
 
 
487 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  37.7 
 
 
490 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  35.81 
 
 
497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  32.37 
 
 
542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1847  carboxylesterase type B  36.43 
 
 
556 aa  223  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105867  normal  0.0362661 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  33.94 
 
 
541 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  32.95 
 
 
506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  35.92 
 
 
527 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  33.78 
 
 
501 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  33.46 
 
 
506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  34.7 
 
 
540 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  34.04 
 
 
553 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  28.6 
 
 
553 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  36.57 
 
 
477 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  34.08 
 
 
518 aa  194  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4876  carboxylesterase type B  31.91 
 
 
565 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370989  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  34.14 
 
 
503 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  34.7 
 
 
523 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  34.7 
 
 
523 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  34.7 
 
 
523 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  36.42 
 
 
500 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  31.39 
 
 
551 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  33.21 
 
 
553 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  35.62 
 
 
506 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  34.04 
 
 
523 aa  188  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  33.59 
 
 
496 aa  187  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  33.89 
 
 
535 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  33.46 
 
 
472 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  33.89 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4036  Carboxylesterase type B  33.27 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  33.89 
 
 
535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2933  Carboxylesterase type B  32.63 
 
 
600 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0457474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  35.62 
 
 
468 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  35.62 
 
 
468 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  30.73 
 
 
555 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  35.62 
 
 
468 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2185  Carboxylesterase type B  31.53 
 
 
553 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0323938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  32.53 
 
 
511 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  31.43 
 
 
534 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  34.39 
 
 
507 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  32.05 
 
 
491 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  32.81 
 
 
501 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  33.97 
 
 
537 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  36 
 
 
501 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2344  carboxylesterase, type B  35.9 
 
 
498 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.865646  normal  0.0140105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2352  carboxylesterase, type B  35.9 
 
 
498 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  31.32 
 
 
518 aa  170  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0226  carboxylesterase, type B  31.29 
 
 
519 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  32.75 
 
 
508 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  33.4 
 
 
553 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  31.63 
 
 
502 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0874  carboxylesterase, type B  28.82 
 
 
519 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  33.66 
 
 
520 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  35.59 
 
 
496 aa  166  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3517  carboxylesterase, type B  33.86 
 
 
514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  32.5 
 
 
503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  31.5 
 
 
523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  33.13 
 
 
486 aa  163  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1015  Carboxylesterase type B  32.69 
 
 
474 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  34.68 
 
 
456 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  31.71 
 
 
502 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  33.59 
 
 
531 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  36.21 
 
 
503 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  32.87 
 
 
547 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  29.49 
 
 
543 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  30.76 
 
 
507 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  31.52 
 
 
528 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  28.96 
 
 
554 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  33.08 
 
 
532 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  32.89 
 
 
502 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  31.52 
 
 
502 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  31.6 
 
 
525 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  33.4 
 
 
544 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  28.54 
 
 
551 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  31.77 
 
 
529 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3026  Carboxylesterase type B  32.24 
 
 
509 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  31.52 
 
 
524 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  32.79 
 
 
507 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  28.33 
 
 
546 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  31.12 
 
 
497 aa  149  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  29.23 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  29.38 
 
 
513 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  27.98 
 
 
552 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  30.93 
 
 
576 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3304  carboxylesterase type B  31.85 
 
 
570 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.691589  normal  0.117859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  31.66 
 
 
528 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  32.97 
 
 
547 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  31.47 
 
 
520 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3037  carboxylesterase, type B  32.75 
 
 
479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.505408  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0612  Carboxylesterase type B  32.69 
 
 
430 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  27.95 
 
 
507 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  38.55 
 
 
497 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  30.45 
 
 
524 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  28.44 
 
 
533 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  34.43 
 
 
442 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>