More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0684 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  100 
 
 
506 aa  1024    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  48.99 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  48.88 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  48.68 
 
 
528 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  48.68 
 
 
502 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  49.21 
 
 
520 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  49.19 
 
 
502 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  48.58 
 
 
511 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  47.86 
 
 
518 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  44.81 
 
 
501 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  39.48 
 
 
507 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  42.22 
 
 
518 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  41.54 
 
 
517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  40.38 
 
 
523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  40.38 
 
 
523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  40.38 
 
 
523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  40.34 
 
 
540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  41.36 
 
 
523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  39.43 
 
 
486 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  39.76 
 
 
503 aa  296  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2344  carboxylesterase, type B  41.97 
 
 
498 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.865646  normal  0.0140105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2352  carboxylesterase, type B  41.97 
 
 
498 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  38.63 
 
 
498 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  34.68 
 
 
506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  36.87 
 
 
506 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  38.19 
 
 
497 aa  259  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  36.24 
 
 
513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  36.42 
 
 
555 aa  253  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  36.11 
 
 
490 aa  248  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  39.83 
 
 
547 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  39.57 
 
 
508 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  35.31 
 
 
551 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  35.16 
 
 
523 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2305  carboxylesterase, type B  41.05 
 
 
443 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  36.67 
 
 
524 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  36.36 
 
 
519 aa  236  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  35.48 
 
 
503 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  33.98 
 
 
553 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  33.33 
 
 
543 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  34.89 
 
 
529 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  33.58 
 
 
565 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  36.52 
 
 
501 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  36.16 
 
 
497 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  34.99 
 
 
529 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  35.15 
 
 
524 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  38.1 
 
 
531 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  33.73 
 
 
533 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  35.86 
 
 
472 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  35.54 
 
 
508 aa  224  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  32.74 
 
 
552 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  37.79 
 
 
477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  36.2 
 
 
491 aa  223  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  32.28 
 
 
542 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  37.15 
 
 
553 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  38.22 
 
 
537 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  36.81 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  36.81 
 
 
535 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  37.21 
 
 
520 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  36.81 
 
 
535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  37.59 
 
 
502 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  37.59 
 
 
502 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  36.75 
 
 
528 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  37.65 
 
 
502 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  37.35 
 
 
502 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  37.2 
 
 
502 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4036  Carboxylesterase type B  32.72 
 
 
537 aa  216  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  33.14 
 
 
507 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  37.1 
 
 
576 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  32.69 
 
 
525 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  36.13 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  37.52 
 
 
506 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  35.98 
 
 
553 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  33.08 
 
 
569 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  35.15 
 
 
525 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  38 
 
 
502 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  35.74 
 
 
544 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  34.79 
 
 
534 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  34.18 
 
 
527 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  36.71 
 
 
547 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  32.41 
 
 
541 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  32.57 
 
 
554 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  31.72 
 
 
546 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4876  carboxylesterase type B  32.01 
 
 
565 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370989  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  37.32 
 
 
456 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  35.39 
 
 
497 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  35.39 
 
 
507 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  36.76 
 
 
522 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  35.18 
 
 
532 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3037  carboxylesterase, type B  36.17 
 
 
479 aa  203  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.505408  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0247  Acetylcholinesterase  37.58 
 
 
517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12560  carboxylesterase type B  33.46 
 
 
531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.982249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  33.46 
 
 
496 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  31.25 
 
 
551 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3599  Carboxylesterase type B  31.24 
 
 
575 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  35.12 
 
 
507 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2933  Carboxylesterase type B  32.56 
 
 
600 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0457474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4398  carboxylesterase, type B  33.4 
 
 
476 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70076  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2002  Carboxylesterase  35.17 
 
 
527 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  34.18 
 
 
487 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  31.67 
 
 
553 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>