More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2898 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  100 
 
 
553 aa  1100    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  40.08 
 
 
527 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  39.36 
 
 
498 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  38.66 
 
 
534 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  38.28 
 
 
555 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  35.29 
 
 
553 aa  299  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  35.42 
 
 
506 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  35.31 
 
 
542 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  37.79 
 
 
553 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2185  Carboxylesterase type B  34.57 
 
 
553 aa  276  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0323938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1847  carboxylesterase type B  37.96 
 
 
556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105867  normal  0.0362661 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  36.05 
 
 
506 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  37.04 
 
 
497 aa  270  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4876  carboxylesterase type B  35.09 
 
 
565 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370989  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  33.87 
 
 
541 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0226  carboxylesterase, type B  34.25 
 
 
519 aa  259  7e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  34.77 
 
 
551 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  35.45 
 
 
490 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  36.45 
 
 
519 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  33.08 
 
 
551 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3517  carboxylesterase, type B  34.94 
 
 
514 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  34.61 
 
 
523 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  34.78 
 
 
517 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  35.12 
 
 
503 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  35.87 
 
 
500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  35.76 
 
 
487 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  33.98 
 
 
506 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  33.53 
 
 
501 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  35.2 
 
 
553 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  34.39 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  34.1 
 
 
523 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  33.52 
 
 
547 aa  217  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3037  carboxylesterase, type B  35.48 
 
 
479 aa  216  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.505408  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  33.4 
 
 
540 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  34.56 
 
 
477 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  34.36 
 
 
528 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  33.8 
 
 
518 aa  210  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  35.01 
 
 
547 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  31.72 
 
 
513 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  33.79 
 
 
529 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  34.43 
 
 
553 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  32.16 
 
 
497 aa  207  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  32.62 
 
 
523 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  32.62 
 
 
523 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  32.62 
 
 
523 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  30.53 
 
 
552 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  32.23 
 
 
518 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4398  carboxylesterase, type B  35.63 
 
 
476 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70076  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  36.29 
 
 
522 aa  203  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  34.23 
 
 
535 aa  203  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  34.23 
 
 
535 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  34.23 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  32.42 
 
 
507 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12560  carboxylesterase type B  34.04 
 
 
531 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.982249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  30 
 
 
507 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  35.49 
 
 
506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  34.32 
 
 
532 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  33.77 
 
 
472 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  34.82 
 
 
456 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  33.6 
 
 
524 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  31.62 
 
 
537 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  31.84 
 
 
486 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  30.48 
 
 
525 aa  192  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  31.87 
 
 
502 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  33.96 
 
 
502 aa  190  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  32.08 
 
 
502 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  32.08 
 
 
502 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  32.29 
 
 
502 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  33.78 
 
 
531 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  32.08 
 
 
502 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  30.99 
 
 
543 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  34.1 
 
 
503 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  32.04 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  33.82 
 
 
544 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  30.48 
 
 
501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5622  Carboxylesterase  30.65 
 
 
521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384767 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5662  Carboxylesterase type B  33.46 
 
 
589 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  31.49 
 
 
565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  28.65 
 
 
569 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  33.01 
 
 
576 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  30.27 
 
 
554 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1297  Carboxylesterase type B  30.83 
 
 
571 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4036  Carboxylesterase type B  33.33 
 
 
537 aa  181  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0874  carboxylesterase, type B  29.63 
 
 
519 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  29.8 
 
 
502 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  32.37 
 
 
468 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  32.37 
 
 
468 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  29.79 
 
 
520 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  31.99 
 
 
442 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  31.37 
 
 
497 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  32.76 
 
 
533 aa  177  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7204  carboxylesterase type B  30.92 
 
 
529 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233652  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  32.43 
 
 
468 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  32.71 
 
 
508 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  30.37 
 
 
524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  33.4 
 
 
501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3376  Carboxylesterase type B  30.39 
 
 
562 aa  174  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  30.89 
 
 
502 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2379  Carboxylesterase type B  30.68 
 
 
569 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  30.99 
 
 
525 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>