201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4266 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  100 
 
 
528 aa  1057    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  40.65 
 
 
525 aa  347  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  40.83 
 
 
533 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  38.62 
 
 
507 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  41.39 
 
 
524 aa  309  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  39.2 
 
 
565 aa  309  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  35.14 
 
 
546 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  37.23 
 
 
543 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  39.92 
 
 
547 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  37.25 
 
 
513 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  35.38 
 
 
554 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  39.35 
 
 
522 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  36.45 
 
 
529 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  35.21 
 
 
508 aa  270  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  38.77 
 
 
547 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  36.65 
 
 
553 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  35.98 
 
 
553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  38.23 
 
 
524 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  39.26 
 
 
531 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07521  carboxylesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09230)  35.01 
 
 
560 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1584  carboxylesterase, type B  37.73 
 
 
522 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  40.28 
 
 
516 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  40.28 
 
 
535 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  40.08 
 
 
535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  40.12 
 
 
537 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5622  Carboxylesterase  34.99 
 
 
521 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  37.23 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  38.31 
 
 
576 aa  239  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2002  Carboxylesterase  38.1 
 
 
527 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  34.87 
 
 
498 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  34.58 
 
 
506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  36.02 
 
 
502 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  36.02 
 
 
502 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  38.65 
 
 
501 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  36.02 
 
 
502 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  35.82 
 
 
502 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  36.38 
 
 
569 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  33.72 
 
 
552 aa  227  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  35.8 
 
 
502 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  36.66 
 
 
507 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  36.53 
 
 
502 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  35.21 
 
 
525 aa  223  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2132  carboxylesterase type B  37.03 
 
 
501 aa  220  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0594066  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  36.07 
 
 
520 aa  220  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  36.75 
 
 
506 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1297  Carboxylesterase type B  32.5 
 
 
571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  36.67 
 
 
544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0247  Acetylcholinesterase  36.51 
 
 
517 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  34.36 
 
 
553 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  34.29 
 
 
551 aa  210  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  33.78 
 
 
542 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  37.22 
 
 
497 aa  206  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0684  Carboxylesterase type B  32.89 
 
 
574 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2379  Carboxylesterase type B  32.15 
 
 
569 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  33.14 
 
 
517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  36.64 
 
 
519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3376  Carboxylesterase type B  31.95 
 
 
562 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  34.18 
 
 
501 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  33.84 
 
 
508 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  31.52 
 
 
551 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  33.33 
 
 
503 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  33.15 
 
 
540 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  34.13 
 
 
518 aa  189  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3599  Carboxylesterase type B  30.71 
 
 
575 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  32.76 
 
 
502 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  33.58 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  33.01 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  34.1 
 
 
477 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  31.44 
 
 
541 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  33.74 
 
 
529 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  32.96 
 
 
523 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  35.74 
 
 
456 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5662  Carboxylesterase type B  32.71 
 
 
589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  33.58 
 
 
487 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  33.53 
 
 
490 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  32.06 
 
 
506 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2933  Carboxylesterase type B  31.39 
 
 
600 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0457474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4908  Acetylcholinesterase  33.27 
 
 
501 aa  177  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511048  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7204  carboxylesterase type B  33.08 
 
 
529 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233652  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  32.44 
 
 
518 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  33.79 
 
 
520 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  33.46 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  33.46 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  33.46 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  32.46 
 
 
507 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  34.01 
 
 
527 aa  173  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  34.1 
 
 
503 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1863  carboxylesterase, type B  32.65 
 
 
569 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4398  carboxylesterase, type B  32.7 
 
 
476 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70076  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  31.84 
 
 
532 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  33.2 
 
 
502 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  33.2 
 
 
528 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  33.2 
 
 
502 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1847  carboxylesterase type B  32.95 
 
 
556 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105867  normal  0.0362661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  34.65 
 
 
501 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  33.13 
 
 
511 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  33.61 
 
 
472 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4595  Carboxylesterase type B  31.75 
 
 
550 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  32.23 
 
 
523 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  33.2 
 
 
497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>