264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4416 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  100 
 
 
507 aa  1027    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  46.2 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  39.48 
 
 
506 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  37.84 
 
 
511 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  38.99 
 
 
502 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  39.72 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  38.79 
 
 
528 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  38.79 
 
 
502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  38.15 
 
 
518 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  36.31 
 
 
520 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  38.29 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  38.68 
 
 
523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  38.68 
 
 
523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  38.68 
 
 
523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  37.74 
 
 
517 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  36.75 
 
 
518 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  36.71 
 
 
540 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  36.29 
 
 
523 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  35.13 
 
 
503 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  35.27 
 
 
486 aa  256  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2352  carboxylesterase, type B  37.19 
 
 
498 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2344  carboxylesterase, type B  37.19 
 
 
498 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.865646  normal  0.0140105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  32.19 
 
 
506 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  34.77 
 
 
498 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  34.57 
 
 
497 aa  230  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  34.31 
 
 
490 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  33.53 
 
 
503 aa  220  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  35.38 
 
 
502 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  32.88 
 
 
555 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  32.79 
 
 
507 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  34.91 
 
 
502 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  34.91 
 
 
502 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  34.28 
 
 
502 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  34.67 
 
 
502 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  34.47 
 
 
501 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  30.64 
 
 
542 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  31.59 
 
 
534 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  33.33 
 
 
552 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4036  Carboxylesterase type B  33.21 
 
 
537 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  30 
 
 
553 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  32.49 
 
 
506 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  34.98 
 
 
529 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  38.67 
 
 
525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  33.08 
 
 
500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  33.41 
 
 
524 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  36.28 
 
 
553 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  34.89 
 
 
502 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2305  carboxylesterase, type B  36.07 
 
 
443 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  34.27 
 
 
456 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  34.02 
 
 
477 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  36.24 
 
 
547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  33.86 
 
 
547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  36.21 
 
 
543 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  34.1 
 
 
513 aa  189  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  31.72 
 
 
519 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  31.72 
 
 
569 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  35.54 
 
 
522 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0226  carboxylesterase, type B  30.72 
 
 
519 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  32.87 
 
 
506 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  41.32 
 
 
507 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  31.07 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  32.68 
 
 
472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  34.82 
 
 
537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  35.49 
 
 
544 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  31.72 
 
 
546 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  31.51 
 
 
551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  30.81 
 
 
541 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  29.94 
 
 
551 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  32.18 
 
 
523 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  31.52 
 
 
496 aa  180  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  33.19 
 
 
508 aa  179  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  33.12 
 
 
531 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  32.93 
 
 
491 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  33.97 
 
 
501 aa  177  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  34.73 
 
 
532 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  30.66 
 
 
497 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3026  Carboxylesterase type B  33.47 
 
 
509 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  34.98 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1015  Carboxylesterase type B  33.41 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  34.98 
 
 
535 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  34.98 
 
 
535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  32.39 
 
 
442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  33.54 
 
 
553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  32.78 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  29.54 
 
 
527 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  35.14 
 
 
554 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  34.45 
 
 
507 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4876  carboxylesterase type B  29.09 
 
 
565 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370989  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  31.46 
 
 
525 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  32.96 
 
 
487 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  32.8 
 
 
497 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  34.83 
 
 
503 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3037  carboxylesterase, type B  30.88 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.505408  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  32.81 
 
 
508 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3304  carboxylesterase type B  30.52 
 
 
570 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.691589  normal  0.117859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2852  Carboxylesterase type B  34.44 
 
 
439 aa  164  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  31.35 
 
 
553 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  31.25 
 
 
468 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  31.25 
 
 
468 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  31.45 
 
 
468 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>