More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1506 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  100 
 
 
529 aa  1061    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  45.25 
 
 
506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  43.71 
 
 
491 aa  343  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  40 
 
 
497 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  41.04 
 
 
472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  40.23 
 
 
501 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  42.01 
 
 
477 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  35.9 
 
 
503 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  40.04 
 
 
503 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0874  carboxylesterase, type B  34.86 
 
 
519 aa  259  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  37.24 
 
 
500 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  36.48 
 
 
507 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  36.2 
 
 
498 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  36.17 
 
 
496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  37.6 
 
 
511 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  35.33 
 
 
517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  36.94 
 
 
501 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  35.19 
 
 
506 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  34.5 
 
 
497 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  32.49 
 
 
506 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  35.9 
 
 
540 aa  228  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  37.5 
 
 
456 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  36.83 
 
 
442 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  36.02 
 
 
497 aa  223  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  32.2 
 
 
542 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  34.62 
 
 
513 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  35.13 
 
 
523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  35.13 
 
 
523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  35.55 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  35.1 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  35.13 
 
 
523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  35.55 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  35.76 
 
 
468 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1015  Carboxylesterase type B  35.87 
 
 
474 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  36.63 
 
 
523 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  35.71 
 
 
519 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  31.55 
 
 
552 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  33.46 
 
 
551 aa  217  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  34.58 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  33.53 
 
 
553 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  32.4 
 
 
525 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  35.74 
 
 
520 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  35.01 
 
 
553 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  33.9 
 
 
518 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  36.31 
 
 
547 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  35.52 
 
 
502 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  32.51 
 
 
508 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  32.2 
 
 
490 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  32.68 
 
 
555 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  34.95 
 
 
528 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  34.42 
 
 
502 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  33.08 
 
 
565 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  35.32 
 
 
502 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  34.42 
 
 
502 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  34.42 
 
 
502 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  35.57 
 
 
507 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  34.42 
 
 
502 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  32.73 
 
 
507 aa  203  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  34.34 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  29.92 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  34.2 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  33.4 
 
 
502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  34.64 
 
 
553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  35.11 
 
 
487 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  35.4 
 
 
533 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  34.77 
 
 
518 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  34.16 
 
 
486 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3026  Carboxylesterase type B  33.59 
 
 
509 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1541  Carboxylesterase type B  36 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  hitchhiker  0.00729389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  30.95 
 
 
569 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0612  Carboxylesterase type B  36.42 
 
 
430 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  34.66 
 
 
543 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  34.07 
 
 
527 aa  196  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  37.68 
 
 
522 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  30.43 
 
 
554 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  32.02 
 
 
529 aa  193  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  32.56 
 
 
553 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  35.56 
 
 
544 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  34.1 
 
 
524 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2185  Carboxylesterase type B  29.98 
 
 
553 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0323938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1966  carboxylesterase, type B  34.55 
 
 
502 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  34.47 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  35.48 
 
 
508 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4876  carboxylesterase type B  29.96 
 
 
565 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370989  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  33.94 
 
 
520 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  36.35 
 
 
537 aa  187  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  31.16 
 
 
523 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  33.89 
 
 
503 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  33 
 
 
534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  33.74 
 
 
528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  35.04 
 
 
524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  35.14 
 
 
546 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2344  carboxylesterase, type B  34.53 
 
 
498 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.865646  normal  0.0140105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2352  carboxylesterase, type B  34.53 
 
 
498 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  32.66 
 
 
531 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  31.44 
 
 
501 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  33.65 
 
 
547 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  34.88 
 
 
507 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1847  carboxylesterase type B  31.7 
 
 
556 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105867  normal  0.0362661 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  31.91 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>