More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0612 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0612  Carboxylesterase type B  100 
 
 
430 aa  863    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  41.59 
 
 
487 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  34.97 
 
 
498 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  32.91 
 
 
506 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  36.42 
 
 
529 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2852  Carboxylesterase type B  37.2 
 
 
439 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  34.6 
 
 
477 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  34.86 
 
 
497 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  35.16 
 
 
501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  34.25 
 
 
519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  34.53 
 
 
472 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  33.69 
 
 
490 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  34 
 
 
506 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  33.33 
 
 
533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  33.05 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  37.33 
 
 
442 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  33.91 
 
 
456 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1170  carboxylesterase, type B  37.85 
 
 
380 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244419  normal  0.980563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  33.89 
 
 
507 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  38.28 
 
 
551 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  34.22 
 
 
537 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  36.63 
 
 
531 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3813  Carboxylesterase type B  34.74 
 
 
459 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  31.8 
 
 
517 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  34.53 
 
 
497 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2002  Carboxylesterase  32.37 
 
 
527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  31.66 
 
 
528 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  34.06 
 
 
523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  32.7 
 
 
534 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  33.48 
 
 
540 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  32.9 
 
 
553 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  32.9 
 
 
523 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  33.26 
 
 
544 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  34.3 
 
 
520 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  32.97 
 
 
553 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  35.73 
 
 
501 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  34.02 
 
 
518 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2478  carboxylesterase, type B  28.64 
 
 
450 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00267035  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2527  carboxylesterase type B  28.64 
 
 
450 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000040809  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  31.25 
 
 
507 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  35.71 
 
 
543 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
522 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  30.98 
 
 
525 aa  159  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0145  carboxylesterase, type B  32.86 
 
 
445 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  28.14 
 
 
542 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1944  Carboxylesterase  33.84 
 
 
553 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  0.353299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2132  carboxylesterase type B  33.69 
 
 
501 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0594066  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  35.5 
 
 
547 aa  155  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  30.42 
 
 
569 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  30.77 
 
 
513 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  33.62 
 
 
553 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0226  carboxylesterase, type B  31.5 
 
 
519 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  32.22 
 
 
503 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  36.99 
 
 
535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  36.99 
 
 
516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  36.99 
 
 
535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44208  predicted protein  41.73 
 
 
937 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1584  carboxylesterase, type B  32.83 
 
 
522 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4398  carboxylesterase, type B  34 
 
 
476 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70076  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  30.74 
 
 
524 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  32.29 
 
 
547 aa  152  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  33.4 
 
 
511 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  30.9 
 
 
518 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  33.48 
 
 
503 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  33.06 
 
 
508 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  30.72 
 
 
502 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  32.33 
 
 
532 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  32.38 
 
 
486 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  30.72 
 
 
502 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  30.72 
 
 
502 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  32.85 
 
 
507 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  30.72 
 
 
502 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  34.13 
 
 
500 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2379  Carboxylesterase type B  36.68 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112663 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  30.72 
 
 
502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  30.91 
 
 
501 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1863  carboxylesterase, type B  31.8 
 
 
569 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365563  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  30.22 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3026  Carboxylesterase type B  33.04 
 
 
509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  33.83 
 
 
506 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  28.73 
 
 
529 aa  146  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0305  Carboxylesterase type B  31.29 
 
 
428 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  30.53 
 
 
503 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  31.3 
 
 
491 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12560  carboxylesterase type B  32.69 
 
 
531 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.982249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  31.66 
 
 
523 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  30.27 
 
 
525 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  31.66 
 
 
523 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  31.66 
 
 
523 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  34.43 
 
 
551 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  32.37 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1297  Carboxylesterase type B  34.05 
 
 
571 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  28.98 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  29.83 
 
 
508 aa  141  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3125  carboxylesterase, type B  32.56 
 
 
520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.616834  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3517  carboxylesterase, type B  31.69 
 
 
514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  30.3 
 
 
497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3599  Carboxylesterase type B  44.44 
 
 
575 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  30.53 
 
 
565 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  31.39 
 
 
502 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>