More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1170 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1170  carboxylesterase, type B  100 
 
 
380 aa  763    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244419  normal  0.980563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0305  Carboxylesterase type B  35.62 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0612  Carboxylesterase type B  37.85 
 
 
430 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0145  carboxylesterase, type B  35.79 
 
 
445 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3813  Carboxylesterase type B  35.88 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  45.1 
 
 
487 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  32.14 
 
 
498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  32.96 
 
 
519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  32.65 
 
 
551 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27280  carboxylesterase type B  35.39 
 
 
431 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.289499  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  30.93 
 
 
518 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0954  carboxylesterase, type B  33.25 
 
 
523 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  28.47 
 
 
542 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  41.18 
 
 
506 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  32.83 
 
 
534 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  31.42 
 
 
496 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4606  Carboxylesterase type B  35.14 
 
 
531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31989  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  30.33 
 
 
569 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  31.46 
 
 
553 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6769  Carboxylesterase type B  41.86 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681683  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  45.73 
 
 
501 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2852  Carboxylesterase type B  32.95 
 
 
439 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  33.65 
 
 
540 aa  126  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  30.73 
 
 
501 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  31.86 
 
 
497 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  31.28 
 
 
527 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  30.4 
 
 
497 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  29.29 
 
 
518 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  31.97 
 
 
576 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  31.39 
 
 
506 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  32.96 
 
 
472 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3037  carboxylesterase, type B  38.19 
 
 
479 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.505408  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  31.25 
 
 
506 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  32.58 
 
 
537 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0226  carboxylesterase, type B  30.81 
 
 
519 aa  123  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  42.79 
 
 
503 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44208  predicted protein  49.02 
 
 
937 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  41.87 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  41.87 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  43.6 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  41.87 
 
 
535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  29.76 
 
 
553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  30.02 
 
 
517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  31.39 
 
 
477 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  31.19 
 
 
502 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  30.32 
 
 
553 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  32.06 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  32.06 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  32.06 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  45.06 
 
 
486 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  30.19 
 
 
523 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  32.63 
 
 
547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  31.27 
 
 
513 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3378  Carboxylesterase  51.05 
 
 
525 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.57709 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09130  cholinesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01710)  44.44 
 
 
728 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2035  carboxylesterase family protein  26.55 
 
 
451 aa  116  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0603486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  30.95 
 
 
528 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  31.78 
 
 
468 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  30.95 
 
 
502 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  31.78 
 
 
468 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  31.25 
 
 
553 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  31.78 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  32.93 
 
 
533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  33.95 
 
 
506 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  32.12 
 
 
544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2527  carboxylesterase type B  25.72 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000040809  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2478  carboxylesterase, type B  25.72 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00267035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  42.86 
 
 
529 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0067  carboxylesterase, type B  43.35 
 
 
646 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  33.42 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  30.59 
 
 
511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0247  Acetylcholinesterase  52.48 
 
 
517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  44.79 
 
 
532 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  43.59 
 
 
547 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  28.29 
 
 
555 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2305  carboxylesterase, type B  32.63 
 
 
443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.240607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12560  carboxylesterase type B  31.03 
 
 
531 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.982249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2132  carboxylesterase type B  50.34 
 
 
501 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0594066  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2344  carboxylesterase, type B  32.63 
 
 
498 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.865646  normal  0.0140105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2352  carboxylesterase, type B  32.63 
 
 
498 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.158305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4398  carboxylesterase, type B  33.42 
 
 
476 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70076  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  42.25 
 
 
456 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  30.38 
 
 
508 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  30.6 
 
 
502 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4016  Carboxylesterase type B  36.72 
 
 
551 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137205  hitchhiker  0.000523092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  30.13 
 
 
524 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11125  para-nitrobenzyl esterase  47.52 
 
 
229 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0684  Carboxylesterase type B  42.41 
 
 
574 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  29.41 
 
 
525 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2379  Carboxylesterase type B  43.2 
 
 
569 aa  106  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  32.26 
 
 
500 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5622  Carboxylesterase  41.82 
 
 
521 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384767 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02879  hypothetical protein  32.86 
 
 
549 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  31.62 
 
 
507 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  29.03 
 
 
507 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4036  Carboxylesterase type B  31 
 
 
537 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  29.73 
 
 
507 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  45.14 
 
 
520 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  27.23 
 
 
502 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  46.32 
 
 
496 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>