More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1541 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1541  Carboxylesterase type B  100 
 
 
520 aa  988    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  hitchhiker  0.00729389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  46.91 
 
 
503 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  44.75 
 
 
501 aa  299  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2021  Carboxylesterase type B  45.99 
 
 
506 aa  276  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000953164  hitchhiker  0.00956228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2427  putative carboxylesterase  39.1 
 
 
497 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  40.61 
 
 
472 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  42.15 
 
 
500 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  40.78 
 
 
507 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1663  Carboxylesterase type B  38.78 
 
 
491 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3983  carboxylesterase, type B  35.97 
 
 
503 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1506  Carboxylesterase  36.19 
 
 
529 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  39.84 
 
 
456 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5478  carboxylesterase, type B  38.43 
 
 
477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0571044  decreased coverage  0.00892297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  38.98 
 
 
496 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  39.76 
 
 
497 aa  229  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3352  Carboxylesterase type B  39.2 
 
 
442 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  35.27 
 
 
498 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4141  Carboxylesterase  36.54 
 
 
496 aa  225  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  37.96 
 
 
468 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  37.96 
 
 
468 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  37.96 
 
 
468 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02490  carboxylesterase type B  36.66 
 
 
501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1141  carboxylesterase type B  35.12 
 
 
551 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0415  Carboxylesterase type B  36.44 
 
 
519 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3419  carboxylesterase, type B  37.63 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0251652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0321  Carboxylesterase  38.69 
 
 
487 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  36.57 
 
 
553 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0874  carboxylesterase, type B  30.06 
 
 
519 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  33.52 
 
 
506 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4145  Carboxylesterase  30.46 
 
 
542 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0256  Carboxylesterase  36.81 
 
 
547 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3172  carboxylesterase, type B  38.37 
 
 
523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.752046  normal  0.0347741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1529  Carboxylesterase  32.5 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348412  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1303  carboxylesterase, type B  34.33 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.147042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2898  Carboxylesterase type B  32.91 
 
 
553 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5051  carboxylesterase, type B  34.03 
 
 
507 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2895  carboxylesterase, type B  36.51 
 
 
523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.794639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2865  carboxylesterase, type B  36.51 
 
 
523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4013  carboxylesterase type B  36.75 
 
 
547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0954265  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2909  carboxylesterase, type B  36.51 
 
 
523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376197  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0670  Acetylcholinesterase  35.95 
 
 
518 aa  181  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0684  Carboxylesterase  36.93 
 
 
506 aa  180  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00959142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  34.75 
 
 
511 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0812  Carboxylesterase  35.16 
 
 
540 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  33.67 
 
 
525 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1730  carboxylesterase, type B  35.19 
 
 
497 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338702  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0976  Carboxylesterase  34.46 
 
 
518 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0892066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4036  Carboxylesterase type B  35.42 
 
 
537 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0612  Carboxylesterase type B  34.42 
 
 
430 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0778  carboxylesterase, type B  30.72 
 
 
508 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4416  Carboxylesterase type B  34.99 
 
 
507 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  30.8 
 
 
569 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  33.71 
 
 
502 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1428  Carboxylesterase type B  30.6 
 
 
513 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  32.54 
 
 
490 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1015  Carboxylesterase type B  34.07 
 
 
474 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  34.7 
 
 
543 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1741  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1873  Carboxylesterase type B  35.16 
 
 
532 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  34.02 
 
 
502 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  34.73 
 
 
537 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
502 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1719  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.11342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1737  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  32.36 
 
 
553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1534  carboxylesterase, type B  33.26 
 
 
502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1028  carboxylesterase, type B  34.51 
 
 
535 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1011  carboxylesterase, type B  34.14 
 
 
516 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1038  carboxylesterase, type B  34.51 
 
 
535 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  38.18 
 
 
554 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3569  carboxylesterase, type B  35 
 
 
522 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  33.9 
 
 
553 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1039  carboxylesterase type B  33.2 
 
 
534 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2130  Carboxylesterase type B  34.53 
 
 
544 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808845  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0145  carboxylesterase, type B  34.79 
 
 
445 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4876  carboxylesterase type B  28.24 
 
 
565 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370989  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2609  carboxylesterase, type B  33.4 
 
 
486 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0169625  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1694  carboxylesterase type B  32.14 
 
 
524 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.152473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1405  Carboxylesterase type B  32 
 
 
507 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.534271  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0723  Carboxylesterase  32.8 
 
 
508 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3787  carboxylesterase, type B  34.23 
 
 
503 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0762  Carboxylesterase  32.58 
 
 
524 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069677  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6351  Carboxylesterase type B  31.94 
 
 
506 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.567991  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1904  Carboxylesterase type B  30.26 
 
 
529 aa  156  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4869  carboxylesterase type B  30.58 
 
 
555 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12560  carboxylesterase type B  33.46 
 
 
531 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.982249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4266  carboxylesterase, type B  33.79 
 
 
528 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  47.42 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0182  carboxylesterase, type B  32.79 
 
 
565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  47.42 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  47.42 
 
 
502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0443  carboxylesterase, type B  30.67 
 
 
552 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4398  carboxylesterase, type B  35.53 
 
 
476 aa  154  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70076  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4777  Carboxylesterase  32.69 
 
 
576 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3813  Carboxylesterase type B  33.67 
 
 
459 aa  153  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3376  Carboxylesterase type B  32.46 
 
 
562 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1619  carboxylesterase, type B  39.01 
 
 
501 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  44.5 
 
 
546 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0584  carboxylesterase type B  31.42 
 
 
527 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2132  carboxylesterase type B  34.19 
 
 
501 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0594066  normal  0.500534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>