More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3323 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
313 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.43 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  35.68 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.34 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.83 
 
 
297 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  36.09 
 
 
315 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  36.09 
 
 
292 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  36.09 
 
 
315 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  36.52 
 
 
315 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  36.52 
 
 
412 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  36.52 
 
 
315 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.07 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.27 
 
 
294 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  50 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.91 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.75 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.21 
 
 
302 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.21 
 
 
333 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  34.24 
 
 
306 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  33.33 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.82 
 
 
300 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  45.45 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.47 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.93 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  33.06 
 
 
314 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  46.88 
 
 
322 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.91 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  29.09 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  37 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.37 
 
 
318 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  32.73 
 
 
294 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.4 
 
 
277 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.81 
 
 
301 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  28.03 
 
 
310 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.71 
 
 
420 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  28.52 
 
 
316 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.41 
 
 
301 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.02 
 
 
301 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  27.94 
 
 
316 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  31.37 
 
 
314 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2198  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.14 
 
 
276 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  28.96 
 
 
644 aa  99  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  33.52 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  32.46 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  49.54 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  38.89 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.51 
 
 
301 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  27.36 
 
 
308 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.43 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  34.88 
 
 
321 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  35.35 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.94 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  41.8 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.46 
 
 
1094 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  28.06 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  33.7 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  29.7 
 
 
274 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  27.94 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  41.74 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  31.87 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  28.76 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  36.3 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  36.88 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  42.73 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.88 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.31 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.2 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  29.74 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.72 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44208  predicted protein  34.33 
 
 
937 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  39.16 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2303  esterase/lipase-like protein  33.16 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.73 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  31.25 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  28.36 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3921  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.68 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  35.71 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.74 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.63 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  37.76 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  27.44 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.43 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  37.1 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.34 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.68 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.33 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.19 
 
 
628 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  29.91 
 
 
593 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  28.19 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  27.24 
 
 
283 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  30.21 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  39.2 
 
 
501 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  27.67 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.95 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.86 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  30.2 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  23.44 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.78 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.89 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>