More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1716 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  584  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  59.03 
 
 
288 aa  341  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  55.47 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  44.84 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  46.01 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  43.4 
 
 
301 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  40.07 
 
 
266 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  40.89 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  36.92 
 
 
296 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  40.28 
 
 
284 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  40.27 
 
 
285 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  37.31 
 
 
287 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  40.54 
 
 
280 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.2 
 
 
294 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  35.98 
 
 
291 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  31.05 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  33.8 
 
 
275 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  34.16 
 
 
274 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  36.21 
 
 
283 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  35.82 
 
 
257 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  33.33 
 
 
269 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  37.75 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  34.43 
 
 
272 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  33.45 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  33.21 
 
 
283 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  32.34 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  35.18 
 
 
282 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  35.86 
 
 
281 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  32.93 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  29.48 
 
 
271 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.71 
 
 
302 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  33.69 
 
 
284 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  28.46 
 
 
271 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  34.77 
 
 
289 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 
277 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  36.87 
 
 
208 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.33 
 
 
290 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  30.97 
 
 
276 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  32.62 
 
 
283 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.3 
 
 
311 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.63 
 
 
297 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.78 
 
 
300 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  28.46 
 
 
261 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  41.38 
 
 
274 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  29.92 
 
 
272 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  29.21 
 
 
276 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.96 
 
 
300 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.06 
 
 
333 aa  99.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  33.7 
 
 
268 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  37.33 
 
 
306 aa  98.6  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  33.21 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  41.46 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  29.41 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  30.59 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  32.46 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  31.75 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  32.09 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  32.09 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  32.04 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.62 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  29.25 
 
 
324 aa  92  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.07 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.13 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.61 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  30.17 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.2 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  32.61 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.64 
 
 
322 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.46 
 
 
336 aa  86.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.02 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.02 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  33.33 
 
 
412 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  27.27 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.24 
 
 
278 aa  85.5  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  33.33 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  33.33 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  33.33 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  33.33 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  33.33 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.65 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  32.58 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.56 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  32.58 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  24 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.92 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  31.82 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.82 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  33.33 
 
 
406 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  31.82 
 
 
359 aa  75.5  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.84 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.22 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  37.34 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  38.06 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  39.17 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>