More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1049 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
360 aa  724    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  58.51 
 
 
412 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  60.26 
 
 
319 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  58.51 
 
 
315 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  58.16 
 
 
315 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  58.51 
 
 
315 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  58.51 
 
 
315 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  58.51 
 
 
292 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  57.65 
 
 
406 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  46.69 
 
 
302 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.02 
 
 
300 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.18 
 
 
322 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.2 
 
 
290 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.65 
 
 
292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  48 
 
 
333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.09 
 
 
300 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  38.39 
 
 
306 aa  212  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3429  hypothetical protein  80.43 
 
 
178 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  44.77 
 
 
309 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  46.75 
 
 
288 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.3 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.42 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.84 
 
 
278 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  44.18 
 
 
301 aa  198  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.45 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  40.56 
 
 
297 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  39.64 
 
 
314 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.16 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  35.79 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  38.93 
 
 
274 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.23 
 
 
294 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  32.26 
 
 
316 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.69 
 
 
308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.65 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.34 
 
 
313 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.28 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.21 
 
 
277 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  31.13 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  27.66 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.45 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  30 
 
 
308 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.19 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.74 
 
 
322 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  31.47 
 
 
403 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.47 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  37.41 
 
 
283 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  34.01 
 
 
285 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.41 
 
 
275 aa  89.7  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  40.98 
 
 
309 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  35.86 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  31.78 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.5 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.12 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.12 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  30.13 
 
 
285 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  27.68 
 
 
321 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.59 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.27 
 
 
1094 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.62 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  26.32 
 
 
431 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  38.73 
 
 
315 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  25.49 
 
 
300 aa  85.9  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  37.67 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.73 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  27.23 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.69 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  31.56 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  32.92 
 
 
288 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  31.65 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.33 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  39.04 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  32.11 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2198  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.4 
 
 
276 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  27.31 
 
 
644 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  25.58 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  28.39 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  25.58 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  35.5 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  25.19 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  27.97 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.76 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.51 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.57 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  26.99 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25096  predicted protein  26.28 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  26.15 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  36.53 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  28.69 
 
 
593 aa  79.3  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1833  esterase-like protein  26.87 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  25.87 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.74 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  26.89 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.45 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  27.27 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.13 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  26.89 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  31 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  36.78 
 
 
502 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5286  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.43 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365819  normal  0.925115 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00390  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>