More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1833 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1833  esterase-like protein  100 
 
 
273 aa  554  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1647  esterase  32.39 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.7 
 
 
311 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  24.36 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.88 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.33 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.01 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.87 
 
 
360 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  31 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.77 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  24.12 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.67 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  23.77 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.5 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.75 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.05 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  24.34 
 
 
411 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  25.12 
 
 
412 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.12 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.71 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  25.12 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  25.66 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.12 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  25.12 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  24.79 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  25.37 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  25.68 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  25.12 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  25.12 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.9 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  25.45 
 
 
332 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  24.62 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  22.61 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.38 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  26.13 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  22.58 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.76 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  22.02 
 
 
407 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.02 
 
 
407 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  26.63 
 
 
406 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  25.79 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  20.94 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.37 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  21.66 
 
 
407 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.47 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  27.64 
 
 
334 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.25 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  28.57 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.79 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.37 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  22.69 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.89 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  24.02 
 
 
376 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.14 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  29.45 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.14 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  25.11 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  21.39 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  25 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.27 
 
 
422 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.28 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  24.66 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  27.24 
 
 
334 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.22 
 
 
319 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  24.24 
 
 
471 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.04 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  22.64 
 
 
331 aa  56.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.18 
 
 
322 aa  55.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  25 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  22.78 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  21.25 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.62 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.2 
 
 
665 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.47 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  22.05 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  23.67 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1292  esterase/lipase  26.36 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0609  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.1 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0167175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  20.96 
 
 
407 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  25.34 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  20.99 
 
 
645 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  25.97 
 
 
334 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4504  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.7 
 
 
303 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0564939  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  25.97 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.37 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3462  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.86 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.477584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.89 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  26.26 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0387  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.84 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.2 
 
 
311 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.61 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0610  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.1 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.88 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.47 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.76 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3420  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.1 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  23.38 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  22.05 
 
 
412 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.47 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>