More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3106 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  100 
 
 		 305 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.78 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  40.73 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  39.41 
 
 		 316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  39 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.48 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  36.8 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  29.47 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.17 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.45 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.15 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.2 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.31 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.51 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.89 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  30.47 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  33.72 
 
 		 593 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.88 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.56 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  29.27 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  37.04 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.94 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  28.72 
 
 		 644 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  30.28 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.73 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.73 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  29.74 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.24 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  33.18 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  27.81 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.78 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.95 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0191  carboxylesterase family protein  31.79 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  28.64 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.01 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.39 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.87 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11953  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.82 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  31.4 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  31.4 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  30.71 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.44 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  29.96 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  31.77 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  27.31 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  30.54 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  33.58 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  31.65 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.29 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.29 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  29.71 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.43 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  27.36 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.87 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  37.74 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  33.08 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  40.52 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3924  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.57 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  32.8 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.78 
 
 		 407 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.78 
 
 		 407 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  33.93 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.13 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  29.38 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.03 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  35.11 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.8 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.48 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.67 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.26 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.46 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.13 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.76 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00427  acetyl esterase  29.25 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00432  hypothetical protein  29.25 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  26.44 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30 
 
 		 1094 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.75 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  32.89 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.82 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.28 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.84 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3140  acetyl esterase  29.25 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.848607  hitchhiker  0.00168444 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.21 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  34.48 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.59 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  30 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29600  esterase/lipase  36.51 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.51 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.21 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.51 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3134  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.85 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.999028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0553  acetyl esterase  28.85 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.55 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0519  acetyl esterase  28.85 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.71 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  38.79 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.82 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>