More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  100 
 
 
408 aa  812    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5474  esterase/lipase  51.65 
 
 
429 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  37.32 
 
 
391 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  29.01 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.62 
 
 
426 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.91 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  32.84 
 
 
431 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.17 
 
 
407 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.82 
 
 
420 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.78 
 
 
407 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.78 
 
 
407 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.1 
 
 
1094 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  32.58 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.3 
 
 
322 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.53 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.98 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.89 
 
 
412 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.2 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  24.63 
 
 
334 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  33.49 
 
 
334 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  31.95 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.71 
 
 
321 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  34.26 
 
 
334 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  34.26 
 
 
322 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  24.26 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12506  carboxylesterase lipQ  33.33 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329664  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  29.51 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  26.91 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.4 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  29.92 
 
 
644 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  39.22 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  28.21 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  29.9 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  29.43 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  29.43 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.39 
 
 
308 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  28.76 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.6 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  29.58 
 
 
325 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  28.57 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.4 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  29.43 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  28.69 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  41.67 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  34 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.59 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.81 
 
 
333 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.04 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.08 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.4 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.03 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  30.63 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  29.33 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.23 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.49 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  28.5 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1489  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.65 
 
 
646 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.475976  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  33.98 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.27 
 
 
288 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  28.23 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  28.82 
 
 
287 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.33 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2781  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.17 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  24.35 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  38 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.84 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  29.92 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  27.73 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  27.04 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.39 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  28.57 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  26.83 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  27.85 
 
 
306 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6663  Carboxylesterase type B  35.04 
 
 
569 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.453104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.32 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.69 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.74 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  27.16 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2267  putative esterase/lipase  33.59 
 
 
321 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  29.46 
 
 
292 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  35.45 
 
 
314 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  29.46 
 
 
315 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  29.46 
 
 
315 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  25.93 
 
 
294 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.75 
 
 
638 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.5 
 
 
628 aa  63.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  28.22 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  26.8 
 
 
657 aa  63.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  28.22 
 
 
315 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1430  esterase  24.46 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2448  esterase  24.46 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.34 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  24.03 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.18 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3383  esterase  24.46 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1194  carboxylesterase Est2  24.46 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.5931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1921  carboxylesterase Est2  24.46 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2325  carboxylesterase Est2  24.46 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>