More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5258 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  39.49 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  32.85 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  35.29 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  33.97 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  31.73 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  31.37 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  31.15 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  34.2 
 
 		 272 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  32.29 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  32.29 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  32.7 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  32.29 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  32.95 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  32.95 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  32.95 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  32.18 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  34.09 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  33.46 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  33.75 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  32.66 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  30.4 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  34.47 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  34.47 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  29.71 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  31.87 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  31.18 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  32.81 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.36 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  30.35 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  32.97 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  32.27 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  34.87 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  31.23 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  31.78 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  31.82 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  29.21 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  30.6 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.96 
 
 		 288 aa  99  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  30.36 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  31.01 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  26.92 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  31.47 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.78 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  31.47 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  31.47 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  31.47 
 
 		 412 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.65 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  31.47 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  31.47 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  29.41 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.34 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  30.34 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.41 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.59 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  30.45 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  36.88 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  32 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  28.77 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  31.51 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  23.08 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.59 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  27.78 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  26.74 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  26.16 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.37 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.61 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  29.96 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  28.24 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  28.57 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  24.55 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.27 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  25 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.49 
 
 		 1094 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  26.37 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.35 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.14 
 
 		 380 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  24.07 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  33.93 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.64 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.91 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  38.02 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  28.81 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  38.51 
 
 		 406 aa  72  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  30.43 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.1 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.34 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  36 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  26.2 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  28.34 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  34.78 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  30.86 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0644  putative hydrolase  32.85 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  30.53 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  26.38 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.15 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>