More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2759 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  100 
 
 		 336 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  53.92 
 
 		 645 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  47.37 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.99 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  35.29 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  39.52 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.77 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.3 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  42.05 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  37.13 
 
 		 471 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.1 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.59 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  36.22 
 
 		 300 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  35.4 
 
 		 326 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  38.22 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.01 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.67 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.94 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.63 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3874  hypothetical protein  36.64 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  36.67 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  33.44 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.4 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  33.48 
 
 		 644 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.36 
 
 		 1094 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  30 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  32.81 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  29.63 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  38.52 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  32.34 
 
 		 340 aa  109  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.27 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  44 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03310  esterase/lipase  33.8 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  29.41 
 
 		 403 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  37.55 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  31.58 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  31.98 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.7 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.7 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.7 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  32.41 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.73 
 
 		 288 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.78 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.78 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12506  carboxylesterase lipQ  31.63 
 
 		 421 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.82 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  32.52 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.45 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  37.7 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1546  esterase/lipase  30.45 
 
 		 314 aa  95.9  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0472354  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.33 
 
 		 294 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  29.78 
 
 		 431 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  30.6 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.97 
 
 		 409 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  28.97 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5245  Esterase/lipase-like protein  30.99 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.1 
 
 		 422 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.96 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.74 
 
 		 412 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  27.16 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  32.55 
 
 		 412 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  32.55 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  32.55 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2357  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.54 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00444827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.44 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.22 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  27.42 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  32.02 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  32.28 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  35.32 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  32.28 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  29.96 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  32.28 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2048  esterase/lipase  28.62 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  29 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  29 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  28.19 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  29 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  30.64 
 
 		 593 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.25 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  28.16 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  29.66 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  29.28 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3921  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.99 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.99 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  36.3 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.26 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.62 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.62 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  26.46 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  44.35 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  24.59 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.32 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.6 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  30.04 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  36.49 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  31.6 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>