More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3874 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3874  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  33.69 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.64 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  31.23 
 
 		 317 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  29.97 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  29.73 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  29.73 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.62 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  30.97 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.83 
 
 		 272 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.94 
 
 		 645 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  28.36 
 
 		 347 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.5 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.08 
 
 		 1094 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  30.15 
 
 		 471 aa  89  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.71 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.68 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.61 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  29 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.11 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  31.47 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2048  esterase/lipase  26.88 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  29.44 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.33 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  29.32 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.15 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.94 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.65 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  30.71 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03310  esterase/lipase  31.29 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.01 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  29.21 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.12 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.24 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 		 422 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  31.92 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.57 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.81 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  28.46 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  26.49 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  28.46 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  28.46 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  33.04 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.09 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1546  esterase/lipase  25.83 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0472354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1444  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.96 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.290312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.63 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.91 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  31.94 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  23.64 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  24.69 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  34.75 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1582  esterase/lipase-like protein  25.23 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  26.17 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  36.3 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  35.4 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2863  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.45 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5283  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.29 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.966169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11223  probable lipase  28.06 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.877155  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1292  esterase/lipase  27.88 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1333  putative lipase  34.31 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0109525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4309  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.69 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.11 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  28.16 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  33.88 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.29 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.59 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.82 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5440  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.31 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  22.48 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  33.1 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.93 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.94 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  31.03 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.88 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  35.65 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  26.12 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0445  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.94 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.215683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.08 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.08 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  31.13 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  33.79 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.94 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.94 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.73 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.94 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1090  putative lipase/esterase  43.37 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.644515 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  28.35 
 
 		 681 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.56 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.3 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  27.51 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  31.82 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  33.33 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.44 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.42 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.42 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3416  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.81 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.27 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.48 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3171  Esterase/lipase-like protein  34.65 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>