More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3171 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3171  Esterase/lipase-like protein  100 
 
 
359 aa  733    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2931  Esterase/lipase-like protein  46.82 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  39.17 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  38.02 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.17 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.46 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  34.4 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.39 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  39.13 
 
 
593 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  34.72 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  30.7 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1292  esterase/lipase  34.15 
 
 
253 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.41 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.22 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  38.32 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  32.35 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.13 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.2 
 
 
302 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  32.23 
 
 
274 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  31.85 
 
 
644 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.38 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  35.11 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  37.3 
 
 
314 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.72 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11223  probable lipase  25.22 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.877155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.45 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  32.79 
 
 
326 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.88 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.59 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  30 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  36.45 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1874  acetyl esterase/ sugar hydrolase  30.51 
 
 
338 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169934  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.24 
 
 
321 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2303  esterase/lipase-like protein  32.87 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  28.87 
 
 
431 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  31.93 
 
 
305 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3439  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.12 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  30.61 
 
 
309 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  35.83 
 
 
310 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1943  esterase/lipase  31.54 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.28 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  27.83 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.13 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  32.5 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4599  carboxylesterase type B  30.81 
 
 
553 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  34.82 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.83 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  36.21 
 
 
288 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  28.97 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  29.79 
 
 
286 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  34.11 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2782  lipase, active site  32.54 
 
 
314 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.42851  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3874  hypothetical protein  34.65 
 
 
304 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  32.03 
 
 
273 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  35.48 
 
 
269 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  31.19 
 
 
509 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.63 
 
 
279 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  30.73 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  34.43 
 
 
301 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.69 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  30.58 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.25 
 
 
420 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0309  lipase/esterase, putative  26.45 
 
 
349 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.78 
 
 
407 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.78 
 
 
407 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.71 
 
 
322 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  35.54 
 
 
334 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  33.94 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.77 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7656  lipase, active site  33.33 
 
 
316 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.03 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  38.54 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  33.59 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8360  Esterase/lipase-like protein  32.74 
 
 
362 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  32.58 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.02 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  37.35 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  30.17 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  34.21 
 
 
296 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3093  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.38 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.71 
 
 
1094 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.65 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.35 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.65 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  35.19 
 
 
503 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1415  heroin esterase  30.33 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0841271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 
301 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.44 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  34.78 
 
 
303 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  28.37 
 
 
391 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3173  acetyl esterase, putative  33.06 
 
 
341 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0693  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.7 
 
 
347 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0470894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0678  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.7 
 
 
347 aa  53.1  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26 
 
 
310 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.94 
 
 
301 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  33.6 
 
 
292 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.77 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3236  carboxylesterase type B  33.02 
 
 
497 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>