More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0027 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  100 
 
 
509 aa  1057    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  32.56 
 
 
238 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  31.98 
 
 
231 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  31.38 
 
 
197 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  29.59 
 
 
216 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  32.29 
 
 
268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  29.72 
 
 
240 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  31.96 
 
 
230 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  30.61 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
217 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  30.65 
 
 
248 aa  106  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  31.38 
 
 
233 aa  104  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  29.21 
 
 
280 aa  103  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2385  hypothetical protein  32.61 
 
 
372 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  29.23 
 
 
207 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  24.37 
 
 
243 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  35.06 
 
 
325 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  22.99 
 
 
871 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  32 
 
 
167 aa  78.2  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.15 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.94 
 
 
324 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.49 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.07 
 
 
324 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  33.71 
 
 
322 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.67 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  33.71 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  34.29 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  29.78 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.05 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  30.14 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  25.25 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.05 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  28.08 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  31.06 
 
 
644 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.84 
 
 
321 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.6 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  32.61 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  39.29 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  27.05 
 
 
318 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  23.38 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.17 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1148  carboxylesterase, type B  37.82 
 
 
507 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.45 
 
 
311 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  28.44 
 
 
323 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  35.38 
 
 
285 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  31.51 
 
 
391 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.03 
 
 
360 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  23.05 
 
 
334 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0292  esterase/lipase-like protein  29.71 
 
 
288 aa  63.9  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0097365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.39 
 
 
645 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  33.33 
 
 
310 aa  63.9  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  33.58 
 
 
317 aa  63.9  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  29.84 
 
 
333 aa  63.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  37.01 
 
 
328 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  32 
 
 
543 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  26.02 
 
 
249 aa  63.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.41 
 
 
344 aa  63.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5622  Carboxylesterase  34.4 
 
 
521 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4223  carboxylesterase, type B  29.77 
 
 
553 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106768  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.38 
 
 
321 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  35.16 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2074  carboxylesterase, type B  32.03 
 
 
537 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.169494  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  31.76 
 
 
300 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  30.6 
 
 
340 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  23.78 
 
 
255 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  27.11 
 
 
261 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  29.1 
 
 
496 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.43 
 
 
313 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  26.19 
 
 
311 aa  60.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.57 
 
 
308 aa  60.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0436  Esterase/lipase-like protein  27.45 
 
 
340 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.68 
 
 
300 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  30.14 
 
 
546 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  31.25 
 
 
554 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.72 
 
 
307 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1874  acetyl esterase/ sugar hydrolase  28.4 
 
 
338 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169934  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06383  carboxylesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10780)  32.59 
 
 
624 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3921  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.02 
 
 
351 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0247  Acetylcholinesterase  30.33 
 
 
517 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  35.71 
 
 
303 aa  58.9  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.53 
 
 
297 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  32.45 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  32.45 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  32.45 
 
 
315 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  32.45 
 
 
315 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  28.31 
 
 
408 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  32.45 
 
 
292 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5662  Carboxylesterase type B  33.85 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  32.45 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  31.65 
 
 
528 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  35.78 
 
 
287 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  31.88 
 
 
502 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4595  carboxylesterase, type B  32.81 
 
 
502 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.452043  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  31.88 
 
 
502 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  33.04 
 
 
500 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  25.84 
 
 
279 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3599  Carboxylesterase type B  31.65 
 
 
575 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.4 
 
 
300 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3376  Carboxylesterase type B  34.17 
 
 
562 aa  58.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1546  esterase/lipase  28.48 
 
 
314 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0472354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>