71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2385 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2385  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  769    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  32.61 
 
 
509 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0134  esterase/lipase-like protein  24.63 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.396672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0510  carboxylesterase  28.97 
 
 
554 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611119  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  32.48 
 
 
314 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.43 
 
 
336 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0459  Carboxylesterase  31.06 
 
 
490 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  26.98 
 
 
339 aa  53.5  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  28.81 
 
 
644 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5611  Carboxylesterase  28.97 
 
 
503 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2863  carboxylesterase type B  28.12 
 
 
553 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0525509  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  29.71 
 
 
593 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  32.11 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4879  Carboxylesterase  30.7 
 
 
456 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0135743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  31.76 
 
 
324 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  28.12 
 
 
309 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0653  Carboxylesterase  22.88 
 
 
543 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.475736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  32.48 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1892  Carboxylesterase  29.73 
 
 
500 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  0.605937 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.17 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12082  carboxylesterase lipT  29.51 
 
 
511 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2745  Carboxylesterase type B  27.27 
 
 
496 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  26.09 
 
 
444 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  25.36 
 
 
344 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.21 
 
 
324 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0610  Carboxylesterase type B  26.09 
 
 
506 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  26.09 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 
320 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.84 
 
 
310 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4256  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.32 
 
 
347 aa  46.2  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0760103  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1874  acetyl esterase/ sugar hydrolase  27.04 
 
 
338 aa  46.2  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169934  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44208  predicted protein  30.56 
 
 
937 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.22 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.12 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3193  putative esterase  25 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  26.47 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3226  carboxylesterase  21.95 
 
 
525 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114767  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1801  carboxylesterase, type B  30.51 
 
 
502 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.712791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3008  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.04 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29610  esterase/lipase  32.69 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.545384  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  29.66 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.84 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.52 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1573  esterase/lipase  23.2 
 
 
303 aa  44.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2012  putative acetyl hydrolace  32.77 
 
 
325 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.57 
 
 
317 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6825  carboxylesterase type B  24.81 
 
 
472 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.47 
 
 
306 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2548  carboxylesterase, type B  26.06 
 
 
502 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.591376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2556  carboxylesterase, type B  26.06 
 
 
502 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  26.63 
 
 
308 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.5 
 
 
406 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2132  carboxylesterase type B  29.17 
 
 
501 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0594066  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5081  Carboxylesterase  25 
 
 
546 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2511  carboxylesterase, type B  26.06 
 
 
528 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3408  carboxylesterase, type B  26.13 
 
 
502 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464351  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29600  esterase/lipase  32.2 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2915  Carboxylesterase  28.3 
 
 
501 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2010  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.26 
 
 
335 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  28.32 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3129  Carboxylesterase  29.46 
 
 
498 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23980  esterase/lipase  29.63 
 
 
281 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.19 
 
 
325 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.46 
 
 
312 aa  43.1  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.3 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.19 
 
 
325 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.12 
 
 
321 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4443  carboxylesterase, type B  28.83 
 
 
468 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4282  carboxylesterase, type B  28.83 
 
 
468 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470779  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.64 
 
 
300 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4216  carboxylesterase, type B  28.83 
 
 
468 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>