45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0219 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  50.79 
 
 
216 aa  206  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  48.15 
 
 
238 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  47.42 
 
 
207 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  44.44 
 
 
257 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  37.57 
 
 
871 aa  158  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  43.6 
 
 
233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  42.51 
 
 
268 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  42.69 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  36.7 
 
 
230 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  38.73 
 
 
280 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  31.38 
 
 
509 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  47.58 
 
 
167 aa  117  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  29.63 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  32.28 
 
 
231 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  29.84 
 
 
240 aa  104  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  31.75 
 
 
232 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  28.87 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  28.25 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  28.74 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  27.88 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  28 
 
 
249 aa  62  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 
447 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  26.47 
 
 
424 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.08 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  27.32 
 
 
241 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  26.18 
 
 
479 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  27.54 
 
 
331 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  26.35 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  27.72 
 
 
274 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  28.77 
 
 
383 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  24.5 
 
 
236 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  26.92 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.62 
 
 
265 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  25.48 
 
 
348 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  41.03 
 
 
48 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  24.23 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  24.23 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  28.33 
 
 
235 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  22.87 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37185  predicted protein  24.74 
 
 
206 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.098769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  26.42 
 
 
261 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  23.76 
 
 
268 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>