50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1357 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  56.94 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  52.07 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  48.15 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  43.75 
 
 		 197 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  43.75 
 
 		 216 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  41.97 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  43.02 
 
 		 238 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  34.54 
 
 		 217 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  33.61 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  39.66 
 
 		 167 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  39.43 
 
 		 207 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  36.6 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  33.13 
 
 		 871 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  30.61 
 
 		 509 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  25.68 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  33.14 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  33.15 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  32.31 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  29.89 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  26.52 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  58.54 
 
 		 48 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  26.05 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  29.14 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.94 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  26.19 
 
 		 447 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  28.67 
 
 		 383 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  25.58 
 
 		 424 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  24.62 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  29.1 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.22 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  27.63 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  26.78 
 
 		 479 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  25.95 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  24.84 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  24.57 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  30.2 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  22.16 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  23.63 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  26.96 
 
 		 372 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37185  predicted protein  21.35 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.098769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.39 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  22.73 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  21.81 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  29.41 
 
 		 1234 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  28.77 
 
 		 275 aa  42  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.5 
 
 		 287 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  27.17 
 
 		 248 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  28.77 
 
 		 286 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>