150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0718 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  33.88 
 
 
424 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  35.98 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  30.91 
 
 
447 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  37.65 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  30.29 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  30.32 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  28.25 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  30.81 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  28.32 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  29.56 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  29.78 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  30.39 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  34.64 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  28.27 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.94 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  30.35 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  30.11 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  25.84 
 
 
871 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  35.84 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  24.61 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  25.13 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  28.49 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  27.32 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  28.4 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  25.55 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.01 
 
 
183 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  27.8 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  29.08 
 
 
331 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  24.71 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  26.88 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  30.93 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  24.73 
 
 
231 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  23.78 
 
 
509 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  29.87 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.17 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  28.84 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  27.78 
 
 
1072 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  36.9 
 
 
167 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  30.99 
 
 
152 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  28.11 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  23.7 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2398  hypothetical protein  26.11 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  28.57 
 
 
479 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  31.25 
 
 
372 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  26.09 
 
 
201 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.94 
 
 
186 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  29.35 
 
 
206 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  23.96 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.03 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  22.99 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  28.4 
 
 
383 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4395  lipolytic protein G-D-S-L family  25.74 
 
 
213 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.750338  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  25.4 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  24.87 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  27.32 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  32.16 
 
 
241 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  31.63 
 
 
457 aa  52  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  27.42 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  26.32 
 
 
593 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  24.72 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  25.91 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  29.9 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  25.91 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  32.17 
 
 
361 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  26.34 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  27.08 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  23.38 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  31.98 
 
 
422 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  27.84 
 
 
204 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  29.85 
 
 
324 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  32.87 
 
 
361 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  29.41 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  29.56 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  26.22 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  31.86 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1563  lipolytic protein G-D-S-L family  31.48 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.88 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  27.04 
 
 
648 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.95 
 
 
201 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  28.88 
 
 
204 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  27.6 
 
 
214 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  28.72 
 
 
329 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  27.66 
 
 
200 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  33.33 
 
 
216 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  31.41 
 
 
348 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  23.27 
 
 
226 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  32.84 
 
 
343 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  29.59 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2498  putative acyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 
186 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  30.17 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  28.81 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  28.57 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  31.11 
 
 
414 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  26.32 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  30.17 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  32.41 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  27.43 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>