43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2847 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.45 
 
 
186 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.9 
 
 
287 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1183  hypothetical protein  42.62 
 
 
552 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  36.81 
 
 
261 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  35.36 
 
 
248 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  28.9 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  25.71 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  28.26 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  30.11 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  27.67 
 
 
152 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  36.23 
 
 
422 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  31.91 
 
 
420 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  26.34 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  29.89 
 
 
447 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  31.37 
 
 
414 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2398  hypothetical protein  25.76 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  31.16 
 
 
409 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  22.4 
 
 
249 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  30.77 
 
 
407 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.49 
 
 
183 aa  51.6  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  29.44 
 
 
424 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  25.59 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  27.32 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  27.54 
 
 
383 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  26.44 
 
 
274 aa  49.3  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2498  putative acyl-CoA thioesterase  23.74 
 
 
186 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  24.85 
 
 
372 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  24.74 
 
 
321 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  28.02 
 
 
241 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  26.32 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  27.73 
 
 
171 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  26.35 
 
 
331 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  34.62 
 
 
430 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  31.21 
 
 
423 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  29.58 
 
 
422 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  22.92 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  30.5 
 
 
418 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  26.74 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3231  polysialic acid capsule biosynthesis N-acylneuraminate cytidylyltransferase NeuA  23.08 
 
 
418 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.14 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3012  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.46 
 
 
417 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4778  lipolytic protein G-D-S-L family  29.25 
 
 
417 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>