33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2398 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2398  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  32.39 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  27.81 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  28.07 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.15 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  26.11 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.65 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  29.69 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  25.76 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  24.47 
 
 		 249 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  23.79 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  21.26 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  27.14 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  23.28 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  32.69 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  27.27 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.13 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  27.42 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  26.79 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4395  lipolytic protein G-D-S-L family  21.12 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.750338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  34.92 
 
 		 424 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  43.18 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  30.12 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  27.53 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  25.15 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  27.37 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  26.97 
 
 		 275 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  21.81 
 
 		 241 aa  42  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  26.97 
 
 		 286 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  25.79 
 
 		 275 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>