167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2090 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  100 
 
 		 277 aa  533  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  69.04 
 
 		 279 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  70.97 
 
 		 286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  70.97 
 
 		 275 aa  305  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  72.12 
 
 		 269 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  70.51 
 
 		 275 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  51.84 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  51.84 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  51.43 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  46.73 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.49 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  41.18 
 
 		 327 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.75 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.23 
 
 		 303 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  42.72 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  40.69 
 
 		 379 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  40.59 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  33.73 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  40.28 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  33.2 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  36.45 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  32.1 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  31.73 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  37.34 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  31.37 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  33 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  31.85 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  32.24 
 
 		 288 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  34.75 
 
 		 328 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  34.32 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  33.84 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  32.12 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  34.76 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  32.89 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  39.13 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  38.89 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.26 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  29.9 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  30.6 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  31.22 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  32.98 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  31.79 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.05 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  31.49 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  31.03 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  30.14 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  28.04 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  29.78 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  33.53 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  32.26 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  28.3 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.89 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.73 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  29.41 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  34.78 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  31.98 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  31.38 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.5 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.81 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.84 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  31.4 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.41 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  38.75 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  27.86 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.81 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  32.22 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 		 220 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  25.53 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  27.86 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  26 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  27.96 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  25 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  30.05 
 
 		 202 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  30.21 
 
 		 226 aa  52.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  29.63 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.34 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  25.23 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  27.72 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  27.53 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  27.23 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  31.84 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  28.81 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  27.96 
 
 		 222 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  30.08 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  31.51 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  29.51 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  25.39 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  32.12 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  23.78 
 
 		 219 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  25.52 
 
 		 200 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  39.19 
 
 		 216 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  28.22 
 
 		 188 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  27.88 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  29.74 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  39.19 
 
 		 216 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0206  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 		 173 aa  48.9  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  29.65 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  31.44 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  24.87 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>