47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2134 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  100 
 
 
248 aa  497  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  49.5 
 
 
287 aa  184  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  43.41 
 
 
261 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  36.89 
 
 
252 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.46 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  35.36 
 
 
230 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  30.04 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  35.84 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  28.74 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  31.74 
 
 
447 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  30.15 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  35.62 
 
 
305 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1183  hypothetical protein  27.12 
 
 
552 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  24.55 
 
 
226 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  29.53 
 
 
194 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  32.99 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  27.05 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  29.84 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  31.02 
 
 
331 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  27.93 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  29.48 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  27.12 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  28.21 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  34.19 
 
 
220 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  33.04 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  30.6 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2398  hypothetical protein  27.4 
 
 
218 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  24.14 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  28.79 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  26.78 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  31.25 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2498  putative acyl-CoA thioesterase  23.67 
 
 
186 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  29.14 
 
 
204 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  24.81 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.52 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  30.38 
 
 
452 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.56 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  31.46 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  27.17 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  27.27 
 
 
428 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  27.61 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4395  lipolytic protein G-D-S-L family  26.47 
 
 
213 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.750338  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  28.02 
 
 
648 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  25.69 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  22.57 
 
 
1072 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  25.12 
 
 
264 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>