122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0275 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  54.59 
 
 
225 aa  247  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  57.59 
 
 
219 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  33.01 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  29.7 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  31.02 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  29.86 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  29 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  31.22 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  29.15 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2979  hypothetical protein  30.62 
 
 
295 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000369688  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  28.48 
 
 
241 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  26.37 
 
 
286 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02630  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  26.09 
 
 
453 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  28.71 
 
 
267 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  26.37 
 
 
275 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  28.87 
 
 
188 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  28.35 
 
 
188 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.12 
 
 
188 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  28.18 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  25.76 
 
 
269 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
456 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.32 
 
 
287 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  22.71 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  26.73 
 
 
267 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  26.73 
 
 
267 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 
229 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  27.84 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  26.7 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  26.73 
 
 
279 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  25.74 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.09 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  23.91 
 
 
374 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  24.38 
 
 
275 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  30.36 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.6 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.87 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1223  lipolytic protein G-D-S-L family  24.4 
 
 
316 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  23.66 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  23.72 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  25.47 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  25.47 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.5 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  24.87 
 
 
255 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  26.17 
 
 
277 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  26.18 
 
 
264 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  25.87 
 
 
379 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  24.11 
 
 
366 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  25.87 
 
 
318 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  27.92 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  23.28 
 
 
358 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3916  lipolytic protein G-D-S-L family  23.02 
 
 
281 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  24.35 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38196  predicted protein  25.11 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  24.51 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.76 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2398  hypothetical protein  21.26 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  33.9 
 
 
248 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  27.06 
 
 
280 aa  48.5  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  25.13 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  25.6 
 
 
249 aa  48.5  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  23.83 
 
 
307 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  26.5 
 
 
249 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1252  lipolytic protein G-D-S-L family  24.51 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1675  lysophospholipase L1 related esterase  24.49 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0367034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  26.87 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25 
 
 
329 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.38 
 
 
327 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  26 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  22.43 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.88 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.88 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06064  GDSL Lipase/Acylhydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08920)  24.05 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0665  hypothetical protein  22.12 
 
 
333 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  23.65 
 
 
322 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  22.77 
 
 
283 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0029  GDSL family lipase  25.62 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  24 
 
 
261 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  24.74 
 
 
396 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  25.9 
 
 
250 aa  45.1  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  24.75 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  22.44 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  24 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.27 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  29.73 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  29.33 
 
 
422 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  21.13 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  25.63 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  24.64 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18481  predicted protein  22.07 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.228231  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3998  hypothetical protein  23.19 
 
 
528 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  23.5 
 
 
457 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  27.78 
 
 
407 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  22.96 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25 
 
 
831 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07231  lysophospholipase L1 and related esterase  23.22 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.613017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  23.04 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>