171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3079 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  64.66 
 
 
275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  64.66 
 
 
286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  66.8 
 
 
275 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  65 
 
 
279 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  72.12 
 
 
277 aa  278  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  49.39 
 
 
267 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  49.39 
 
 
267 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  54.31 
 
 
267 aa  201  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  41.15 
 
 
318 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.23 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.23 
 
 
303 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  37.32 
 
 
379 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  37.8 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  42.29 
 
 
238 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.56 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  39.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  36.45 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  32.52 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  32.65 
 
 
253 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  30.73 
 
 
250 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  31.2 
 
 
252 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  30.86 
 
 
254 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  33.49 
 
 
285 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  31.67 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  31.53 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  31.33 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  30.84 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  29.84 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  29.07 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  31.02 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  29.52 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  30.32 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  31.41 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.94 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  33.14 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  29.17 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.43 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  37.27 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  31.02 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  30.64 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  31.67 
 
 
201 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  31.98 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  29.67 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  32 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  32.42 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  26.77 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  30.69 
 
 
204 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  31.09 
 
 
202 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  29.95 
 
 
223 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  30.27 
 
 
202 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.69 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  31.58 
 
 
206 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  32.51 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  32.05 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.32 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  25.76 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  28.18 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.6 
 
 
198 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  28.41 
 
 
239 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  31.44 
 
 
203 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.34 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.14 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  29.02 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.14 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  27.39 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  32.67 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  24.46 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.14 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  27.66 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  30.95 
 
 
200 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  32.67 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  27.13 
 
 
200 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  28.72 
 
 
201 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  27.17 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.49 
 
 
226 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.57 
 
 
183 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  26.15 
 
 
212 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  27.62 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  31.17 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  28.96 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  33.1 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1252  lipolytic protein G-D-S-L family  24.12 
 
 
197 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  32.83 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  27.23 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  33.03 
 
 
195 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  37.5 
 
 
218 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  28.21 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  28.57 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  29.19 
 
 
218 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  28.4 
 
 
199 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  28.34 
 
 
201 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  31.01 
 
 
210 aa  52.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  21.67 
 
 
225 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  32.29 
 
 
203 aa  52.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  29.68 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  27.7 
 
 
205 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  28.28 
 
 
300 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  28.42 
 
 
201 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  35.77 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>