32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4395 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4395  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
213 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.750338  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  27.56 
 
 
235 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  28.9 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.23 
 
 
261 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1158  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase NeuA  26.5 
 
 
413 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  26.97 
 
 
447 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.65 
 
 
287 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  27.73 
 
 
383 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  26.4 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  26.88 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  25.74 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  23.4 
 
 
249 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  23.47 
 
 
331 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  26.89 
 
 
372 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  27.64 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  25.64 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.15 
 
 
183 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.11 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  25.68 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  26.29 
 
 
275 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  22.94 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  22.6 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  26 
 
 
236 aa  45.1  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  21.43 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2398  hypothetical protein  21.12 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  23.2 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  27.59 
 
 
1880 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5748  lipolytic protein G-D-S-L family  23.91 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  26.47 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  26.47 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1053  GDSL family lipase  23.94 
 
 
230 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  23.47 
 
 
203 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>