53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3780 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 221 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  47.49 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  43.5 
 
 		 1072 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  44.5 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  34.95 
 
 		 249 aa  141  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  35.68 
 
 		 479 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  33.66 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  32.34 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  27.96 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0019  putative acetylhydrolase  38 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.211042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  31.17 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  31.51 
 
 		 648 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  31.34 
 
 		 593 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  29.35 
 
 		 593 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  29.84 
 
 		 321 aa  97.1  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40919  predicted protein  31.4 
 
 		 422 aa  91.7  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  29.27 
 
 		 348 aa  88.6  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  32.16 
 
 		 447 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  29.74 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47870  predicted protein  23.87 
 
 		 402 aa  72.4  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.504417  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  28.86 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.95 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  27.17 
 
 		 372 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  27.17 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  26.55 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  22.48 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  24.52 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  27.51 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  21.02 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  26.9 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  27.98 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  28.24 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  23.47 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  31.82 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  22.73 
 
 		 871 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  24.31 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  22.33 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  25.13 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  25 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.42 
 
 		 287 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  23.38 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  22.01 
 
 		 238 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.04 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  26.07 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  20 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  22.95 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.76 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  22.02 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0603  GDSL family lipase  33.8 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  0.0431523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  24.84 
 
 		 383 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3828  GDSL family lipase  23.53 
 
 		 375 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  20.77 
 
 		 216 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>