42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2606 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
457 aa  950    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.88 
 
 
500 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  30.39 
 
 
456 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  26.87 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 
213 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  29.07 
 
 
219 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  28.76 
 
 
217 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  27.19 
 
 
213 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  23.15 
 
 
209 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1223  lipolytic protein G-D-S-L family  24.44 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0796712  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  24.31 
 
 
207 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2720  lipolytic protein G-D-S-L family  23.42 
 
 
455 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0378561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4778  lipolytic protein G-D-S-L family  22.96 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  26.13 
 
 
208 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2077  lipolytic protein G-D-S-L family  38.1 
 
 
241 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2979  hypothetical protein  25.11 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000369688  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  27.01 
 
 
209 aa  54.7  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  29.84 
 
 
188 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  34.72 
 
 
424 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  27.45 
 
 
331 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  31.63 
 
 
255 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  24.55 
 
 
189 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  34.44 
 
 
216 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  36.99 
 
 
228 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  29.03 
 
 
188 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  28.44 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.57 
 
 
188 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1374  lipolytic protein G-D-S-L family  20.29 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  23.43 
 
 
225 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  25 
 
 
188 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  26.96 
 
 
261 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  36.99 
 
 
188 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  28.64 
 
 
219 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  23.86 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  22.22 
 
 
220 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  32.26 
 
 
379 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  30.11 
 
 
262 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  34.57 
 
 
227 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  23.66 
 
 
220 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.47 
 
 
628 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  25.36 
 
 
209 aa  43.5  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  24.26 
 
 
252 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>