60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4695 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  41.52 
 
 		 268 aa  134  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  34.74 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  34.67 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  36.41 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  37.93 
 
 		 248 aa  121  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  35.27 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  37.21 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  32.8 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  32.56 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  34.94 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  33.14 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  31.44 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  37.58 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 871 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  30.62 
 
 		 509 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  32.07 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  29.59 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  29.61 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  28.99 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  30.17 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  27.84 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  25.82 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  24.86 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  27.45 
 
 		 171 aa  62  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.23 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  25.81 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  27.14 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.09 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  25.48 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  28.36 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  29.34 
 
 		 424 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  33.15 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  24.14 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  27.62 
 
 		 593 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  28.65 
 
 		 447 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.56 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  26.21 
 
 		 383 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  28.19 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  25.95 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  25.13 
 
 		 593 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  27.78 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  28.8 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  25.95 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  23.38 
 
 		 372 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  22.94 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  28.43 
 
 		 648 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  37.18 
 
 		 479 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  31.33 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  27.63 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37185  predicted protein  24.12 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.098769  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  27.6 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  22.22 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  26.85 
 
 		 416 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  27.32 
 
 		 1072 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  25.64 
 
 		 331 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  24.82 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  36.19 
 
 		 248 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  26.81 
 
 		 262 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>