80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4423 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
348 aa  674    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  46.43 
 
 
329 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  44.31 
 
 
305 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  41.59 
 
 
348 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  44.72 
 
 
361 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  44.22 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  39.44 
 
 
305 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  39.13 
 
 
376 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  43.91 
 
 
318 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.91 
 
 
318 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  40.42 
 
 
324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  43.48 
 
 
318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  46.19 
 
 
320 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  42.33 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  43.11 
 
 
320 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  40.2 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  43.28 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  37.84 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  40.82 
 
 
347 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  41.41 
 
 
298 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  33.91 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  38.14 
 
 
270 aa  99.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  38.14 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  29.03 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  34.25 
 
 
204 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  25.64 
 
 
219 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  27.27 
 
 
246 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  24.76 
 
 
195 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  34.25 
 
 
235 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  33.7 
 
 
235 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  34.64 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  34.64 
 
 
244 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.64 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.64 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  33.7 
 
 
235 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  34.64 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  34.64 
 
 
267 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  34.65 
 
 
207 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.4 
 
 
258 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  32.4 
 
 
240 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  32.4 
 
 
240 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  27.78 
 
 
263 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.03 
 
 
270 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  22.75 
 
 
197 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  30.73 
 
 
235 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  28.36 
 
 
217 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  23.04 
 
 
197 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  22.51 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  22.28 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  22.87 
 
 
197 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  32.7 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  22.51 
 
 
211 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  22.51 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.93 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  28.72 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  21.99 
 
 
211 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  29.35 
 
 
225 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  32.3 
 
 
247 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  25 
 
 
210 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  21.76 
 
 
196 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  26.04 
 
 
210 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  26.53 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1032  lysophospholipase  23.5 
 
 
223 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.87 
 
 
226 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  25.25 
 
 
204 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  25.13 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1908  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.8 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000035223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  26.74 
 
 
249 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  29.23 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  29.67 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  24.5 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  23.74 
 
 
248 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.24 
 
 
238 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  29.19 
 
 
223 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  26.92 
 
 
201 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  28.42 
 
 
202 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  31.91 
 
 
249 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  27.81 
 
 
204 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  23.35 
 
 
223 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.47 
 
 
211 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>