89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3153 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
305 aa  607  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  62.46 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  58.87 
 
 
320 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.31 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  55.31 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  54.95 
 
 
318 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  59.27 
 
 
320 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  54.96 
 
 
314 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  47.69 
 
 
329 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  41.64 
 
 
376 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  44.67 
 
 
348 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  47.01 
 
 
324 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  47.11 
 
 
361 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  47.58 
 
 
340 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  45.64 
 
 
361 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  43.09 
 
 
343 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  44.08 
 
 
351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  40.95 
 
 
348 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  43.25 
 
 
298 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  37.55 
 
 
368 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  42.66 
 
 
347 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  41.45 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  40.5 
 
 
270 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  41.03 
 
 
204 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  26.77 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  31.43 
 
 
223 aa  60.1  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.36 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  25.81 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.59 
 
 
238 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.64 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  25.85 
 
 
263 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  34.18 
 
 
207 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.77 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  27.78 
 
 
204 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  28.57 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  26.67 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  30.67 
 
 
258 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  27.69 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  29.51 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  26.89 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  28.22 
 
 
240 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  25.13 
 
 
196 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  29.67 
 
 
244 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  26.99 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  21.7 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  29.06 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  24.2 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  24.49 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  29.65 
 
 
235 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  29.03 
 
 
201 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  26.79 
 
 
255 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  29.95 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  23.2 
 
 
244 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.95 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  25.38 
 
 
242 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  28.99 
 
 
260 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  34.26 
 
 
201 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.95 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.95 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  28.32 
 
 
235 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  29.95 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.95 
 
 
244 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  28.78 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  29.65 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  22.96 
 
 
197 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  28.71 
 
 
210 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2206  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.26 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0148894  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  28.7 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0725  lipolytic protein G-D-S-L family  26.61 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  30.86 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  23.47 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  23.65 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  24.67 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  23.08 
 
 
197 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  24.75 
 
 
223 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  23.65 
 
 
197 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  33.03 
 
 
214 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  27.35 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  23.65 
 
 
197 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  28.95 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  26.19 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  27.42 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  27.41 
 
 
210 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  25.25 
 
 
223 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  27.35 
 
 
240 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  29.25 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  24.34 
 
 
237 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  29.69 
 
 
258 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>