More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2107 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  91.03 
 
 		 223 aa  407  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  56.6 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  50.83 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.97 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  49.72 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  42.36 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  44.76 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  47.14 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  48.35 
 
 		 241 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  48.35 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  44.76 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  49.71 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  45.93 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  47.67 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  46.77 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  43.41 
 
 		 252 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  47.31 
 
 		 213 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  48.55 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  49.13 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  44.75 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  48.55 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.4 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.24 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  46.2 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  46.11 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  46.24 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  46.24 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  38.6 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  46.78 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  43.5 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.09 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  41.43 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  41.99 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  41.21 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  46.24 
 
 		 255 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  40.84 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  43.93 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  43.35 
 
 		 255 aa  147  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  39.6 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.98 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  39.46 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  39.88 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.09 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  36.22 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  39.7 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  37.68 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  38.55 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  38.69 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  40.72 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  41.48 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  39.66 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  39.66 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  40.33 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  41.95 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  40.23 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  37.43 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.99 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  39.66 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  38.07 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  34.67 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  36.36 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  42.7 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  41.86 
 
 		 200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  35.51 
 
 		 208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  36.36 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  37.29 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  36.36 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  33.64 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  33.33 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  36.73 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  35.87 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  36.02 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.66 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  37.22 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  36.81 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  33.18 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  40.68 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  35.64 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  36.27 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  36.52 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  36.92 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  36.72 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  36.36 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  38.37 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.55 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  33.18 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  38.37 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  35.75 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  39.2 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  35.52 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  35.96 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  36.63 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  35.52 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  33.67 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  33.7 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  37.99 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.99 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.99 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.77 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>