70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0437 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  100 
 
 
347 aa  675    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  55.82 
 
 
351 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  51.23 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  51.22 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  51.46 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  48.63 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  44.92 
 
 
348 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  48.95 
 
 
361 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  48.77 
 
 
361 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  50.42 
 
 
340 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  39.64 
 
 
368 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  40.38 
 
 
305 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  45.15 
 
 
298 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.4 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  44.4 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  43.83 
 
 
320 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  43.8 
 
 
318 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  39.41 
 
 
305 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  44.12 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  43.39 
 
 
320 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  40.82 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  42.47 
 
 
270 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  39.46 
 
 
270 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  39.23 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  36.64 
 
 
267 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.88 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  35.88 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.88 
 
 
244 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.88 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  35.88 
 
 
244 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.62 
 
 
258 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3261  hypothetical protein  26.67 
 
 
250 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  32.35 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 
270 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.63 
 
 
238 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  32.41 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  31.35 
 
 
235 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  28.7 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  30.81 
 
 
235 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  30.81 
 
 
235 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  32.75 
 
 
235 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  29.89 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  28.29 
 
 
280 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  34.02 
 
 
207 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  35.42 
 
 
244 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  29.36 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  28.14 
 
 
213 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  29.72 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  24.35 
 
 
263 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  29.41 
 
 
226 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  26.34 
 
 
201 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  28.03 
 
 
242 aa  47  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15910  hypothetical protein  30.88 
 
 
249 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  34.78 
 
 
240 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  26.73 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2616  GDSL family lipase  27.67 
 
 
225 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  34.24 
 
 
249 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  29.74 
 
 
223 aa  46.6  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  34.48 
 
 
247 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.41 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7062  lipolytic protein G-D-S-L family  23.15 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  27.27 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  34.26 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3224  lipolytic protein G-D-S-L family  47.06 
 
 
231 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1368  hypothetical protein  29.23 
 
 
249 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  29.41 
 
 
213 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  32.45 
 
 
255 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  29 
 
 
252 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01055  hypothetical protein  27.32 
 
 
217 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02421  hypothetical protein  29.86 
 
 
212 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.564426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>