59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0082 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0082  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
351 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0437  putative secreted protein  57.5 
 
 
347 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  52.01 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8567  hypothetical protein  51.06 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0938  GDSL family lipase  47.23 
 
 
348 aa  232  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  50.15 
 
 
343 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0643  lipolytic protein G-D-S-L family  49.8 
 
 
376 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  49.83 
 
 
361 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  47.84 
 
 
361 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0930  lipolytic protein G-D-S-L family  54.95 
 
 
340 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3985  GDSL family lipase  47.5 
 
 
298 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0334981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  43.85 
 
 
305 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  44.31 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  39.17 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  43.28 
 
 
348 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4151  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.22 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4226  GDSL family lipase  41.22 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.558892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2041  GDSL family lipase  41.46 
 
 
320 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23917  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4382  GDSL family lipase  40.82 
 
 
318 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4676  GDSL family lipase  41.34 
 
 
320 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.694492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11093  hypothetical protein  37.95 
 
 
314 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.963411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0909  GDSL family lipase  43.59 
 
 
270 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0852  GDSL family lipase  42.05 
 
 
270 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3837  lipolytic protein G-D-S-L family  40.72 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.490417  normal  0.0238456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3405  lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  33.16 
 
 
244 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2140  lipolytic protein G-D-S-L family  36.87 
 
 
207 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0136  hypothetical protein  34.64 
 
 
240 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0498  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.75 
 
 
238 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0149  hypothetical protein  37.68 
 
 
235 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0162  hypothetical protein  37.68 
 
 
235 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0148  hypothetical protein  34.08 
 
 
240 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2906  hypothetical protein  37.68 
 
 
235 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  34.8 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  35 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1853  GDSL family lipase  26.11 
 
 
263 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3328  hypothetical protein  37.68 
 
 
235 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3258  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.89 
 
 
258 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  29.19 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  29.08 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2866  hypothetical protein  24.86 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0124  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.15 
 
 
267 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3305  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.15 
 
 
244 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3993  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.15 
 
 
244 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3065  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.15 
 
 
244 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3921  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.15 
 
 
244 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  23 
 
 
196 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.32 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3000  hypothetical protein  33.15 
 
 
267 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02421  hypothetical protein  27.19 
 
 
212 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.564426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  23.27 
 
 
196 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4028  hypothetical protein  30.13 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  24.87 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  27.8 
 
 
289 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  33.82 
 
 
256 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  24.38 
 
 
219 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  32.74 
 
 
247 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  27.49 
 
 
258 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  24.38 
 
 
240 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2055  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25 
 
 
264 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>