260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0540 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
252 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  54.59 
 
 
222 aa  256  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  51.6 
 
 
249 aa  239  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  51.75 
 
 
237 aa  234  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  57.61 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  52.91 
 
 
219 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  49.76 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  50 
 
 
204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  49.49 
 
 
204 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  47.57 
 
 
202 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  45.41 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  42.79 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.59 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  42.72 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  42.93 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  47.18 
 
 
251 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  47.96 
 
 
208 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  47.24 
 
 
201 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48 
 
 
211 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  40.99 
 
 
266 aa  166  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  49.46 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  43.52 
 
 
208 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  45.81 
 
 
226 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.04 
 
 
226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  46.41 
 
 
201 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  48.02 
 
 
213 aa  161  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  46.07 
 
 
217 aa  161  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  40.77 
 
 
216 aa  161  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  40.77 
 
 
216 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  45.3 
 
 
205 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  44.04 
 
 
201 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  45.41 
 
 
213 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  51.46 
 
 
257 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  41.78 
 
 
218 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  43.01 
 
 
201 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  43.01 
 
 
201 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  46.99 
 
 
198 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  44.75 
 
 
201 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  44.62 
 
 
214 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  44.75 
 
 
201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  43.01 
 
 
201 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  37.17 
 
 
239 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  42.49 
 
 
199 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  43.15 
 
 
212 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  42.25 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  43.98 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  42.25 
 
 
241 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  48.54 
 
 
240 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  49.41 
 
 
248 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.89 
 
 
227 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  44.74 
 
 
255 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  43.65 
 
 
201 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.23 
 
 
228 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  41.92 
 
 
255 aa  148  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  47.73 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  39.58 
 
 
219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  46.41 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  40.88 
 
 
202 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  41.21 
 
 
184 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  42.7 
 
 
213 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  41.21 
 
 
222 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  43.33 
 
 
214 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  41.76 
 
 
226 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  38.89 
 
 
224 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  42.78 
 
 
200 aa  141  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  40.2 
 
 
222 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  40.21 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  42.08 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  41.4 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  39.44 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  41.94 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  42.86 
 
 
200 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  41.21 
 
 
224 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  40.66 
 
 
201 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  41.4 
 
 
202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.53 
 
 
184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  38.46 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  40.11 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  43.86 
 
 
214 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  39.78 
 
 
194 aa  138  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  42.19 
 
 
223 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  42.86 
 
 
214 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  40.56 
 
 
215 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  38.89 
 
 
206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  41.11 
 
 
226 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  38 
 
 
255 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  42.78 
 
 
201 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  41.11 
 
 
232 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  41.92 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  41.44 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.84 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  36.89 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  40.56 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  45.51 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  37.91 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  40.56 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  40.31 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  40.31 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.31 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.31 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>