233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3073 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  67.17 
 
 		 214 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  66.83 
 
 		 214 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  65.22 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  64.13 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  63.59 
 
 		 241 aa  248  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  63.04 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  61.08 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  58.54 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  59.18 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  59.18 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  58.73 
 
 		 202 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  55.28 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  58.38 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  56.25 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.69 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  63.48 
 
 		 257 aa  225  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  58.16 
 
 		 218 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  56.41 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  56.22 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  57.89 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  53.4 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.61 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  53.33 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  57.07 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  55.62 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  53.55 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  48.97 
 
 		 240 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  49.45 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  46.81 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  47.67 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  47.09 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.82 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.34 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  46.63 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.46 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  43.89 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  48.02 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  43.46 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  40.87 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  40.87 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  41.38 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  40.11 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  43.86 
 
 		 249 aa  147  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  42.77 
 
 		 266 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.82 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  41.49 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  40.86 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  41.49 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  44.77 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  39.32 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  39.27 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  40.34 
 
 		 237 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  38.5 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  39.78 
 
 		 255 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  37.17 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  42.31 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  37.13 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  39.59 
 
 		 202 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  35.35 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  40 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  39.89 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  38.74 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  37.31 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.22 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  39.11 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.1 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  38.38 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  38.55 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  36.79 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  38.83 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  36.9 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  36.61 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  41.15 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.76 
 
 		 184 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  38 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  40.56 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  38.04 
 
 		 232 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  38.05 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  39.01 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  37.89 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  37.5 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  40 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.87 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.87 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  37.87 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  35.68 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1242  GDSL family lipase  37.44 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  normal  0.178592 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  37.5 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  37.5 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  37.5 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  37.5 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  35.18 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  37.5 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  37.5 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  39.25 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  37.21 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  41.04 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  39.41 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  38.64 
 
 		 201 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>