239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3601 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  100 
 
 		 208 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  99.52 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  86.06 
 
 		 211 aa  360  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  65.98 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  58.85 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  53.3 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  47.64 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  49.74 
 
 		 204 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  51 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.36 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  46.6 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  48.68 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  44.67 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.89 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  47.24 
 
 		 213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  50.79 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  44.67 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  47.87 
 
 		 198 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  43.9 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  43.81 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  41.15 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.96 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.71 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  42.93 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  47.31 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  40.87 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  47.4 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  44.83 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  46.6 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  43.07 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  43.98 
 
 		 218 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  42.57 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38.5 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  40.1 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  42.65 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  40.38 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  41.38 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  46.96 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  39.57 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  42.41 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  41.21 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  41.4 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  39.39 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  41.94 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  39.51 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.79 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  41.4 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  38.27 
 
 		 252 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  39.61 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  39.6 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  36.46 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  33.64 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1901  GDSL family lipase  42.16 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0627412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.84 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  41.94 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  41.94 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2205  Arylesterase  40.54 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  35.27 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  40.11 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1888  GDSL family lipase  39.25 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172385  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  37.19 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  38.22 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  38.42 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  39.78 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  38.71 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  37.95 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2424  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.11 
 
 		 178 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  38.1 
 
 		 255 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  38.14 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  35.61 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  36.08 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.13 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  35.64 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  38.22 
 
 		 184 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  35.44 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  38.42 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  37.43 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  36.13 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.17 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  36.27 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  41.5 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  38.1 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  38.1 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  36.13 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  38.1 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  38.1 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  38.1 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  38.1 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  35.6 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  35.26 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  37.93 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  36.68 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  39.39 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  37.25 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  33.87 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  36.95 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  37.44 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2403  arylesterase  36.04 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  37.82 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  37.57 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>