246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3650 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  100 
 
 
201 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  62.3 
 
 
226 aa  232  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  60.87 
 
 
204 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  56.22 
 
 
213 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  60.31 
 
 
213 aa  222  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  56.77 
 
 
210 aa  220  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  60.1 
 
 
240 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  59.24 
 
 
202 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  59.34 
 
 
218 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  58.7 
 
 
248 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  58.24 
 
 
216 aa  207  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  58.33 
 
 
227 aa  204  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  53.51 
 
 
204 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  57.78 
 
 
211 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  57.69 
 
 
216 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  50 
 
 
241 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  55.38 
 
 
251 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  50 
 
 
241 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  59.02 
 
 
240 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  60.22 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  53.77 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  47.94 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  52.17 
 
 
226 aa  193  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  56.57 
 
 
198 aa  193  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  53.11 
 
 
214 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  55.75 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  53.76 
 
 
210 aa  188  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  53.76 
 
 
216 aa  187  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  52.49 
 
 
214 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  54.69 
 
 
233 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  55.03 
 
 
209 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  51 
 
 
208 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  51 
 
 
208 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  52 
 
 
211 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  50.87 
 
 
255 aa  178  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  50.29 
 
 
219 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  47.24 
 
 
252 aa  168  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  50.26 
 
 
228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  52.15 
 
 
237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  47.73 
 
 
266 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  46.2 
 
 
223 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  45.03 
 
 
223 aa  161  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.74 
 
 
227 aa  161  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.77 
 
 
225 aa  161  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.93 
 
 
270 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  41.94 
 
 
270 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  42.05 
 
 
222 aa  148  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  43.65 
 
 
202 aa  147  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  44.69 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  44.92 
 
 
234 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  44.13 
 
 
201 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  42.6 
 
 
249 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  41.97 
 
 
201 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  42.35 
 
 
215 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  43.11 
 
 
237 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  44.57 
 
 
201 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  41.9 
 
 
213 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  45.28 
 
 
206 aa  141  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  44.09 
 
 
192 aa  141  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  41.99 
 
 
195 aa  141  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  41.99 
 
 
202 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  42.94 
 
 
200 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  42.77 
 
 
200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  42.64 
 
 
223 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  45.83 
 
 
212 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  45.66 
 
 
201 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  38.61 
 
 
208 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  39.47 
 
 
208 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  43.63 
 
 
215 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  45.66 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.95 
 
 
216 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  44.33 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  37.56 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  40.11 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  39.78 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.86 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  38.86 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  43.09 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.86 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  40.4 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.78 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.86 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.78 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.86 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.86 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  38.86 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.86 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  42.22 
 
 
214 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  43.78 
 
 
204 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  41.41 
 
 
202 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  43.35 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  43.93 
 
 
199 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  42.13 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  42.77 
 
 
201 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  40.31 
 
 
219 aa  130  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.34 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  38.71 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  42.2 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.33 
 
 
204 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.33 
 
 
204 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>