263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0389 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  75.66 
 
 
204 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  73.02 
 
 
202 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  70.47 
 
 
204 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  70.68 
 
 
251 aa  275  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  71.66 
 
 
211 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  73.22 
 
 
227 aa  261  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  58.45 
 
 
240 aa  232  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  62.9 
 
 
218 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  55.28 
 
 
213 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  62.11 
 
 
216 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  63.33 
 
 
216 aa  227  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  54.37 
 
 
226 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  57.3 
 
 
239 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  58.47 
 
 
241 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  57.92 
 
 
241 aa  220  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  56.77 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  58.64 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  58.12 
 
 
255 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  60.11 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  52.74 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  52.43 
 
 
255 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  51.96 
 
 
214 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  57.46 
 
 
198 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  50.24 
 
 
214 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  50.46 
 
 
240 aa  201  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  53.3 
 
 
226 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  52.69 
 
 
214 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  49.76 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  47.8 
 
 
216 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  47.75 
 
 
210 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  50.29 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  46.04 
 
 
223 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  44.67 
 
 
208 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  44.16 
 
 
208 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.55 
 
 
270 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  43.88 
 
 
270 aa  164  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  44.33 
 
 
211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  45.09 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  45.18 
 
 
233 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  46.24 
 
 
223 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.36 
 
 
225 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  44.44 
 
 
249 aa  154  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  43.48 
 
 
266 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  40.38 
 
 
212 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  46.37 
 
 
209 aa  151  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  43.01 
 
 
208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  41.44 
 
 
234 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  42.86 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  42.47 
 
 
224 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.24 
 
 
228 aa  144  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  38.38 
 
 
222 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.3 
 
 
237 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.76 
 
 
227 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  41.71 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  39.44 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  42.02 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  41.11 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  41.57 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  41.11 
 
 
202 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  42.7 
 
 
201 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  39.89 
 
 
205 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  41.01 
 
 
201 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  42.93 
 
 
232 aa  138  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  43.01 
 
 
226 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  42.93 
 
 
222 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  43.01 
 
 
226 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  43.01 
 
 
226 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  43.01 
 
 
210 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  42.13 
 
 
201 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  43.01 
 
 
232 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  43.01 
 
 
210 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  43.01 
 
 
226 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  41.57 
 
 
201 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  42.93 
 
 
208 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  42.93 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  43.58 
 
 
201 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  41.88 
 
 
222 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  39.39 
 
 
201 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  41.01 
 
 
199 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  41.26 
 
 
208 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  40.89 
 
 
226 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  42.93 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  42.93 
 
 
207 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  42.93 
 
 
208 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  41.85 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  43.15 
 
 
218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  43.32 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  41.53 
 
 
201 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  42.7 
 
 
184 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.78 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.78 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.78 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.78 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  40.78 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  37.75 
 
 
227 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.09 
 
 
184 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  40.83 
 
 
215 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  40.98 
 
 
225 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  37.76 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>